Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0006600
Sequence Length
2815 nt
GC Content
0.3400
GGACAACAACUAAAAUACAUUUAAAGGCAUUUCAAAUUGGUUCUGUAACAAAGAAAGAAUCCUUGGAGUCAGCUCCAUUCUUAACUGGCACAUAUUUAGUAAGUCAGAUAUGAUUCUUUUGUACAGAAACUAAUGCUUUAAAAGAUAGCAUUUUAAAUUAGUUUACUGUGAAACUGACUUAAAAUGGUAAUUAAAGAUUUUUAAAAUUUUGCUUGUAAAGGAAAAAAUGCCUUAACAUACAAUAAUAUUCAUUAAAACCAAGCUAUUGAGUGAUGAUGCCAAAGAUAGUUUUGAAAAAAUAAUUAACAAUUUAAUAAGGAUAACCAAAAUGAUAAAUUUAAGAUGUUGCUUAACAUGUAACAUGAAAAGCAGUUUAAAAACUGGUCUGAACAUUGCUUCAUUUUCAAUAAAAUAUUUCUCAGUGCAUCCCUUUUAAACCAAUAUUUUUGAUUUAUUUAUUUUAACAUUUUCUCCACAAAUAAUCAGAUAUUUUCUUUCUGUUAUAAAUAAGGAGUGAUUAACUAAUAGGUGUUCAUAAAUGAUAUAAGGCAAAAGACUGUUGUGUAUCUUUUUUUAAAUAAAGAAUUUUUUAUUUAUUAAUUUAUUUAGAGACAGGACAGGGACUCUCUCCAUCACCAAGGCUGGAGUACAGUGGCACAAUCAUAGCUCACUGUAGGCUUUAAGGUGCUUGGGCUCAUGUAAUCCUCCUACCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGGACAUGCCACUAUGCGCAGCCGAUUUUUAAAUUUUUUUGUAGAAACAGGGUCUCACUAUGUUGCACAGGCUGGUCUUGAACUCCUGGACUCAAACAAUCUCCCACCUCGACCUCCCAGAGCACUGGGAUUAUAGGUGUGAACCACUGCACCUGGCCUCUGUAUCUUAUGAAAAGAAGUAAUCUUAUAUAUCAUGUCUUUUUCAGUGAGUGGGUACUUAACAUUUUGAAUACGGAAUAGAGAUUUUCUAGAGAUCAGAAUGUUUUUUGAGAAUGAAUUGUUACUUAAAGCAGUUGAUCUUAACAUUUUUUGAGCCUUAGACUCCUUUGAGACUCUCAAGCAUAUUCUCUACGUCUUUGUAAGGAUAUGUACAUGCAUAGGCUUGAUCACACAGAAUUUUGCCUGCUAUUUAAUGGAGUUCGUGUAUUACCUAAAUGACAACAGCAGUAGCAAUAAUAAAGAUACAGGUACCAACUAACAUUUAUUAAGCUUUAUCUUAUGCUAAGCAAUUUGCUAAAGGCAAUUAUUUCAUUCAAACUCUUUAACCCAAAUUCUAAACAAUUAUCUUAAAAACCAUAGUUAGCAUUCAUUGAACGUUGUCAGGCAUAGUUUGUUGGACUUUAACGUACCUACUCAUUUUUAUCUUCCAAAACAACCUUUUGAAUGAGUAUUAUUAUCAUUCCAGUGAGCUCAGGGUUUUCACCAUGUUGCUAUAUUGCUCUGGGACCUCUGCUGUAAAGUAUUAUUUUCCAGUAUAAGUUCAUAAUCUGUCUACUAUUCUUUUUUUAAUGCGAUAUAUAUAUAGCAUUAUUUUUAAUGUGAUAUUUUUAAUUUUAUAAUAUAUAUAUAUAGAGAGAGAGAGAGAGUUCAUGCCGGCAUAUUUUUAAUCCUCUGGUUAAAGUAUAUACAUAUAUAUGUAUAUAUCUAUAUAUCCUAUAUAGACAUAUAGGCAUAUUUUUAUCCUUUGUUUUCACUCACACUAGUAGAAAUUUCUAGUUUCUUAACCCUGUUUUCCCACAAUUUCUUUCUUCCUUUGUGCUCCAUCUCACCUAUCUCCCAGUUUUGUUUCAUCCUCUUCUAAGAACCCAUUAUAAGUCAGUCCUUCAGCUUUAAGAUUCUGUUUCUGGUUGUUGCUUCUAAUUAACUAAAUGUGGUUUUAUAGGUGCUUUCCAAAGUGUUGUACAGCUGAUAUUUCACUUCAUGUAAUUGUCUUUAUCUGAUGCUUGUUAUGGGAUGAUUAAACACCUAUGUUCCAUGAAAACUAGACUUAUGGAGAAAUGAUGGGUUCAUCCAUUCACUUACUUAUAUGUUGUGUUUAACUUGUUGGAAAAAAUAUUGCUUUUUACUCCCAAUAUGAUACUGUGUUGCAGCUUAAGUAGUAUAUAUUUUUAAAAUUCACUUUUAUACUUACCAGUAGGAUAUCAUCAGAAGAGAGGAAGACAUGAAGGAUGAUUACAUUGAUGUAUUCUUUGUUUUUUCCCUCCCUAUUGGCAGCCAAUAGGAGCUCUGAACCCAAAAAGAGCAGCAUUCUUCGCUGAGCGUUAUGAAUCAUGGGAAGAUGAUCAAGUUCCAAAGUUUCACUAUGGUACUCAUUACUCAACUGCAAGUUUUGUUCUUGCAUGGCUGCUAAGAAUAGAACCCUUUACAACUUAUUUCCUAAAUUUGCAAGGAGGCAAAUUUGAUCAUGCAGAUCGAACUUUUUCAUCAAUUUCCAGAGCUUGGCGAAACAGUCAGCGUGAUACCUCUGAUAUUAAGGAGUUGAUCCCUGAAUUUUAUUAUCUCCCUGAGAUGUUUGUCAACUUCAAUAAUUAUAAUCUUGGAGUGAUGGAUGAUGGGACAGUAGUGUCUGAUGUCGAACUUCCUCCUUGGGCCAAAACCUCAGAAGAAUUUGUUCACAUAAACAGAUUGGCCCUGGAGAGUGAAUUUGUUUCCUGCCAGCUUCACCAAUGGAUUGAUCUCAUUUUUGGCUAUAAACAGCAAGGACCAGAAGCUGUCCGAGCCCUCAAUGUGUUCUAUUACUUGACCUAUGAAGGAGCUGUCAAUCUGAAUUCAAUAACUGAUCCUGUGUUGAGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-649.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -708.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 722.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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