Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0008100
Sequence Length
730 nt
GC Content
0.3205
GUGUCUAUGGUCGUGUGUGGUUUUUUUUCCCCAGGGAUACACAAAAGUGAAUAGAAGUUACAUUCAUACUACAACUUUUUUCUUUCAGUGAUUUUUCUUUUAAAACAAAUUCAUUGAGGUACAAUCUAUAUAUAAUAAAAUUCAACUUCUUAAAGUAUGCAAUUCAAGGAGUUUAGUAAGUGUAUACAGUUAUGUAACUGCCACUACAUUCCAGCUUUAGAACACUCACGAGUACAAAAAGUUUCCUUGGGCCUCUUUAUAGUCAGCCUCUGCUUCCACUGCCGGCUCCAGGCAAUCACUGAUUCUGUCUCUGUUUUGCUUUUCUAGAAAUUUUAUAUUAAUGGAAUCAUACAAUAUGUAGUCUUUUUAUGCCUGUCUUCUUUCAGUUAGCAUGAUGUUUUUUGAGAUUCAUCCAUGUUGUGCAUAUAUCAGUAGUUAAUUUCUUUGUAUUGCUGUAUAGUAUUCCAUUUUAUAGAUAUAUCACAUUUUAAAAUCUCUUUACUAGUUAAUGGACUUUUUUUUCUAGUUUGGGCUAUUAUAAAUAUUUGCGUAUAAGUCUUGGUGUGGACAUCUGUUUUUAUUUCUCUUGGGUAGAUUUCUGGGAAUUCCUGGGUCAUAUAAUAAAAAUGUUUACCAUUUUGUAUUCCUACAAUGUAUGAAGUUUCAGUUUUUCCCUAUCCUUAACAAGACUUGGUAUUGUCAGUCUUAUUUAUUUUAGCCAUUCUAGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-133.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -151.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 179.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((...(..(((.((...((((..((((((((.((........(((.(((((((.............)))))))))).((((((((.(((...........))).))))))))((((.....................((((((((.((........)).))))))))..((.(((((.((.(((((((((........)))))...)))).))..))))).))..)))).....)).)))))))).............((((...((.......)).))))..((((((.((..(((...)))..))..)))))).....((...((((((..(((((((((.(((((((((.((((((.(((((((((........)))...))))))........))))))....)))))))))..((((.((((((((((.....))).)))))))))))).)))))))).))))))....)).......))))...)).)))..)...))))))........((((....(((((..(((((((.(((((..(((((((((....(((.((((((((...........))))))))....(((((...((((((((((((...((((((.....))))))(((....)))..)))))))...)))))...)))))..)))....)))))))))....)).)))...)))))))..)))))...))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({((,.(((((((((......{((....))}..(((....}}|....{,((((,,{{......,,.|||||},...,((((((((.{({...........}}}.))))))))|.......,.,,,........{{{.((((((((.((........)).)))))))).}}}.,})))}},,||,,,}}}))))))))),)))).}}}}},.))),}))){.,,{({,{{{...{{{,||{||(((((......,{{,.(((....)))...,,,)..)))}),}||,||.,|,,{{|..,))),,}}..}}}}}...,,{{{,,.{(((((..((((((({,.{((((((((.((((((.(((((((((........)))...))))))........)))))}....))))))))|,.((((.(((((((,,(.....,),.)))))))))))},)))))))).}))))}...............,........,|,||..,}}})),........{(((..,,(((((..(((((((.((((((((((((((((..,.(((.,{{{{..{,,,........))))))),....(((((...((((((((((((.,.{(((((.....)))))|{||....,}},.)))))))...)))))...)))))..))).,..))))))))},)),}).)))...)))))))..))))),..))))..)
Back