Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0008400
Sequence Length
1922 nt
GC Content
0.4272
GCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAGUAUUACAGAGAGGCUUGAACACGCUUUGGAAAAGGCAGCUCCUCUCCUUCGUGAGAUUUUUGUGGAUUUUGCACCUUUUCUUUCUCGGACACUUUUGGGUAGCCAUGGACAAGAACUGCUUAUAGAAGGAACAAGUCUGGUUUGCAUGAAGUCGAGUAGUUCAGUUGUGGAAUUGGUUAUGCUACUGUGUUCUCAGGAGUGGCAAAAUUCUAUUCAGAAGAAUGCAGGCCUUGCUUUUAUCGAACUUGUCAAUGAAGGAAGGUUGCUUAGCCAGACAAUGAAGGAUCAUCUAGUAAGAGUAGCAAAUGAAGCUGAAUUUAUCCUGAGCAGGCAGAGAGCAGAAGAUAUUCACAGACAUGCGGAAUUUGAGUCACUGUGUGCCCAGUAUUCUGCAGACAAACGAGAAGAUGAGAAGAUGUGUGAUCAUUUGAUAAGAGCAGCAAAAUAUCGUGACCACGUGACAGCAACUCAACUAAUCCAGAAAAUUAUCAACAUUCUCACAGACAAGCAUGGAGCCUGGGGAAAUUCUGCAGUGAGUCGUCCUCUUGAGUUCUGGCGCCUUGACUACUGGGAAGAUGACUUGCGGCGCCGGCGACGAUUUGUGCGUAACCCUCUAGGAUCGACACAUCCUGAAGCGACACUAAAAACAGCCGUGGAACAUGUGUGCAUUUUUAAAUUGAGAGAGAACAGCAAAGCCACAGAUGAAGAUAUCCUUGCUAAAGGAAAACAGUCCAUCAGGAGUCAGGCUUUAGGAAAUCAGAACUCAGAAAACGAGAUCCUCCUGGAAGGCGAUGAUGAUACUCUGUCAUCCGUGGAUGAGAAAGAUUUAGAGAAUCUUGCCGGUCCUGUUAGCCUGAGCACACCAGCUCAGCUUGUGGCCCCCUCUGUUGUAGUAAAGGGCACUCUUUCUGUCACCUCCUCCGAACUCUAUUUUGAGGUGGAUGAAGAGGAUCCUAACUUCAAAAAAAUCGACCCCAAGAUCUUGGCAUAUACAGAAGGGCUGCAUGGAAAAUGGCUGUUCACAGAGAUACGAUCAAUCUUUUCUCGUCGUUAUCUUUUGCAAAAUACAGCCCUGGAGAUCUUUAUGGCAAACAGAGUUGCUGUGAUGUUCAACUUCCCAGACCCUGCAACAGUAAAGAAAGUGGUUAACUAUCUACCUCGUGUUGGCGUUGGAACAAGUUUUGGAUUGCCUCAAACCAGACGUAUUUCAUUAGCUAGUCCACGUCAGCUUUUUAAGGCUUCUAAUAUGACCCAGCGAUGGCAACACAGAGAGAUAUCUAAUUUUGAGUACUUGAUGUUUCUCAACACGAUAGCAGGACGGAGUUAUAAUGACUUAAAUCAGUAUCCAGUGUUUCCUUGGGUCAUCACUAAUUAUGAAUCAGAAGAACUGGAUCUUACCUUGCCCACCAACUUCAGAGAUUUGUCCAAGCCAAUAGGAGCUCUGAACCCAAAAAGAGCAGCAUUCUUCGCUGAGCGUUAUGAAUCAUGGGAAGAUGAUCAAGUUCCAAAGUUUCACUAUGGUACUCAUUACUCAACUGCAAGUUUUGUUCUUGCAUGGCUGCUAAGAAUAGAACCCUUUACAACUUAUUUCCUAAAUUUGCAAGGAGGCAAAUUUGAUCAUGCAGAUCGAACUUUUUCAUCAAUUUCCAGAGCUUGGCGAAACAGUCAGCGUGAUACCUCUGAUAUUAAGGAGUUGAUCCCUGAAUUUUAUUAUCUCCCUGAGAUGUUUGUCAACUUCAAUAAUUAUAAUCUUGGAGUGAUGGAUGAUGGGACAGUAGUGUCUGAUGUCGAACUUCCUCCUUGGGCCAAAACCUCAGAAGAAUUUGUUCACAUAAACAGAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-508.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -546.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 540.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.((((..((.....(((((((((...........((((((((((((...(((((.(((((...((((((((....((((.((((.......(((((....))))))))).)))).....(((((((((....))))))))).....((((((((.((..(((....)))..))..))).))))).))))))))...)))))..((((((((.(((........((((..((((((....))))))...)))).(((((((((...((((((.......))))))...)))))))))(((((.(((((((.((.....)).)))))))))))))))..))))))))......))))).(((....)))........))))))))))))....)))))..))))....((((((((((..........(((((((((((.(.(((...)))).))).))))))))............((((((((((.(..(((((((((.....(((((((........((.((...)).))....(((((.((....(((((.....((..((..(((.((........)))))..))..))..))))).)))))))(((..(((.(((((((((((((..........(.(((....))).))))))((....))...((((((...((.....))..)).))))((((((((((((.............((((......(((.(.((((((...)))))).).)))......))))...........(((((....)))))......(((....))))))..)))))))))...)))))))))))..)))...(((....)))..(((..(((((((...))))))))))((((....(((((((...)))))))....))))....(((.(((((......))))))))((((((((..(((((((.(((..((((..(((((.(..(((((((................)))))))..))))))..)))).))).))............((((....)))).....))))).)))))))).........)))))))....))))..)))))..)))))))))))..))))))))))........))..)))))))))(((((((((......)))))))))((.(((.(((((((((..((((..((((.(((((.((((........)))).((.(((((((.(((((.(((((((((((..((((.(((.(.(((((.................))))).)...))).)))).))))).(((((((((....((.(((((.((((((((((...............)))))))))).....((((........((((((...)))))).......))))..))))).))))))))))).............((.((((...(((............)))....)))).)))))))))))))))))))).))(((((..........)))))....))))).)))).)))....)..)).))))))).))).))(((.(((.(((...))).))).))).........)))))..((((((((((((((....))).)))))))))))..........................((((((((.((.(((((.(((.(((((...(((.((((((((...((((..((((.(.((....(((((.(......).))))).....(((((((((.............((((((...))))))...)))))))))...........)).).))))..)))))))))))).)))...))))))))))))).))))))))))((......)).......((((((((......)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((...}))}.))).....((((,,...((((({.{(({(.(((((((((....,,{,,.,{(((,....|}}|.,.....|,)))))},))}},.})})))))},,))))(((((,|{..,{,((((((,((((.((((({|{{(,,{((((({((((((...,,,..(((....))}.},...,|{{{{||||,,,...}||||..,{{{{|||}{{,.....,.}|}||}}||,{(({{{{||||,,,..{{|{.(((({(,((({{((,((({...,,{||,}}}...)))))||||(((((.(((((((.((.....)).))))))}))))))))...)))),,,.,{,,.,,,})}|{{..,.,|,.{{{{...,,,.)))).,}}..))))))).},)))}..})))..|,,,.}))}}},.,.(((((((((((.(.(((...)))}.))).))))))))......}))))}|..|}}}}},|||||{,((,{.,{|{,.{{{..,,....}},|||}}.,))}|.,..}},,|||....}})))).}}}}..........}))))).}}..}}...)))))((((((......{((((((((((((..(({{(((((((((((((..,.,..,,.{.{||....})),}))))){(....}}...((((((...{(,....))..)).))))((((((((((((.,,......,...((((....,,(((.,.(((((,...,})))),,.))).,,...)))).|,||......(((((....)))))......|{|,,,.))})))..)))))))))...)))))))))))..)))|{,{,,((({(,..{((,..(((((,.,{{||}}}}},||(({(,,(.(((((((...))))))).|,.||||,{,,((,{(((((......))))))}}((((((((..(((((((.(((..((((..(((((({..(((((((....,,..........)))))))..))))))..)))).})}.}}............((({....}))).....))))).))))))))........((((((...{(((((((((((.,........,.)))),,))))))})......))))))||||}||}},(((((((({......)))))))))||.|{{.{{{{||||,..,(((..{{|{.,(((,,(({{...,,,.,))}}.((,(((((((,(((({,({((((,((((.{((,({,,,.,.||{||}.},|,..,,,,.)},,))))){{{{|,...)))),||,,..,{{{{((({....||,,,,,,.((((((((((...............)))))))))),||||||||}|,||},.((((({...})))))...,,.|}|||,,||}}|{|,,|||}||||........}}}}.||}||||.,}|||,},....,,,,.}}}}...,,}),)))}})))))}}})))}})),))(((((..........))))).,,.}}}}}.)))).}}}....}..)),})})))),))).},(((.(((.(((...))).))).)))....,))),}))))}.((((((((((((((....))).)))))))))))........................{,((((((((.((.(((((.(((.(((((...(((.((((((((...((((..((((,(,({....{((((.(.,....}.}}}}}.,,..(((({{{{{....,,,,.....{(((((...)))))),},)))))}}}|,..........}}.),))))..)))))))))))).)))...))))))))))))).)))))))))).}......))}}}}...((((((((......)))))))).
Back