Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0010500

Sequence Length

1244 nt

GC Content

0.4204

AUCUUGGCAUAUACAGAAGGGCUGCAUGGAAAAUGGCUGUUCACAGAGAUACGAUCAAUCUUUUCUCGUCGUUAUCUUUUGCAAAAUACAGCCCUGGAGAUCUUUAUGGCAAACAGAGUUGCUGUGAUGUUCAACUUCCCAGACCCUGCAACAGUAAAGAAAGUGGUUAACUAUCUACCUCGUGUUGGCGUUGGAACAAGUUUUGGAUUGCCUCAAACCAGACGUAUUUCAUUAGCUAGUCCACGUCAGCUUUUUAAGGCUUCUAAUAUGACCCAGCGAUGGCAACACAGAGAGAUAUCUAAUUUUGAGUACUUGAUGUUUCUCAACACGAUAGCAGGACGGAGUUAUAAUGACUUAAAUCAGUAUCCAGUGUUUCCUUGGGUCAUCACUAAUUAUGAAUCAGAAGAACUGGAUCUUACCUUGCCCACCAACUUCAGAGAUUUGUCCAAGCCAAUAGGAGCUCUGAACCCAAAAAGAGCAGCAUUCUUCGCUGAGCGUUAUGAAUCAUGGGAAGAUGAUCAAGUUCCAAAGUUUCACUAUGGUACUCAUUACUCAACUGCAAGUUUUGUUCUUGCAUGGCUGCUAAGAAUAGAACCCUUUACAACUUAUUUCCUAAAUUUGCAAGGAGGCAAAUUUGAUCAUGCAGAUCGAACUUUUUCAUCAAUUUCCAGAGCUUGGCGAAACAGUCAGCGUGAUACCUCUGAUAUUAAGGUACAGAAAUGUUUUGUUUUAUAGUUGUUAUUGCCAGUGCAUUACUUGUUGAGUGAAUGUUGAAAAUUUUCUCUACUGCCAUACAGCCCUAUUUACAAAAGAUAAAUCUCAGAAGAUAAGUCCUUAAUUAAAUGGCCAAGAAUUACAGCAUGUCUCUCUCUGUCUCUAUCUCUUGUCUUUCCCUGGGAGUUUUUGUUGUUAUUGUUUUGUUUUUGUUUUUGUUUUUGUUUUUGUUUUGGAGACAGAGUCUUGCUCUGUCCUUCAGGCUGGAGUGCAAUGGCGUGAUCUUGGCUCACUGCCACCUCCACCUCUAGGGUUCAAGCGAUUCUUCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUCUGCCACAACGCCUGGCUAGUUUUUUUGUAUUUUUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGACUGGUCUGGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCUGCCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGUUGAUAUUACAGGUGUGAGCCACCGCGCCCGGCCUCUCCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-326.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -351.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 358.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((........((((((((((.((.....((((((....(((((((((((............)))).)))))))........))))))((((.((...(((((((((......))))))))).........))))))..(((((........(((.(((.....))).)))...((((((((((((.(((.(.((((.((((.(((.((......)).))).))))..)))).)))))))))(((((....)))))((......))....((....))......((((((((((...............)))))))))))))))))..)))))...((((((...)))))).....((.(((((((.((((..(((.((((........)))).))))))).)))))))))..)).))).......((((.((((((((((......((((((.(((((..........)))))(((.......)))..((..((((......((((((((..((((((.(((.(((...))).))).)))..(((((((...((((((..(((.((.(((((((.((((((((((((((..................(((((((((......)))))))))(((((((.(((.(((....)))))).............((((......)))))))))))...((((.(((....)))))))...)))))))))).)))).)))).))).)).)))..)))))))))))))....)))..))))))))......))))..)))))))).......)))))))))).))))...))))))).........)))))))...((((((...(((((..........................)))))....))))))...................................((((((((((((((...))))))).)))))))..((((.((...((((((....((((((((.((((((.(((.((((((((((...((((....)).))...)))))...((.((((((((......(((....)))......)))))))).))...................))))).))))))........((.(((.(((((((((.((....)).))))...))...)))))).)).(((((((.....)).))))).......))))))))))).))))))..))..))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{{{{(({.....,{{{(((((((.((((.....((((((...{(((((((((((.,..........))))},))))))})......)))))){((({((.,.(((((((((......))))))))),|.||,.,,||||||,..,,{,..((((,.(((({((,,{,,{|...,,,,,((.(((((((.(((({,(((((({((((.,(({(,,{,.,.{({{|,.,,|....,...),..))))),||,,,...)))).}},|,.{{(((((((,,,,({,{{{{,.((((((((((...............)))))))))).,,,,((({{,.{{,..((((({...})))))...,,.|}|||,,||}}|,|,}}|}}||||........,,}}.||,|||{.,,|||,,,......,,.,,,....||||.||})))))))))}))))))).)}(((((..........))))).,{.,||||,}|||,}|,...,|..}},,||||||||},,||(((.(((.(((...))).))).))),,(((((((...((((((..(((.((.(((((((.((((((((((((((..................{((((((((......))))))))}(((((((.{{|.{,,,,.{{{{.{{{{.,.....,|.}}||,}}}}.,))),))))))},,,({{{.,....,}))}}})),..)))))))))).)))).)))),})).)).)))..))))))))))))).,),})}..)))))))})}}}})))).))))))),,,.,,.,,,{{{||{|||,.||||||,{|,|,........,,})}}||}{{{.((((((...,,(((||.,.......,....,.........)))))....)))))).})}.}}..},,.,},,,,,,,,.,}},,...,|,,,{(((((((((((...)))))))},)))||||{((((.((..,((((((....(((({{{{.||||{(,(((.(((({(((({...((({....}}.)).,.))))},..({.((((((((......(((....)))......)))))))).)}...................))))).)))}}}....,,..{{.{{{{{{({{((((.((....)).))))...}},..}}})}},}}.(((((((.....)).))))).....,,)))}}}})))).)))))).,))},,,}),.