Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0014700

Sequence Length

365 nt

GC Content

0.4986

UCGUCCUCUUGAGUUCUGGCGCCUUGACUACUGGGAAGAUGACUUGCGGCGCCGGCGACGAUUUGUGCGUAACCCUCUAGGAUCGACACAUCCUGAAGCGACACUAAAAACAGCCGUGGAACAUGGUCCUGUUAGCCUGAGCACACCAGCUCAGCUUGUGGCCCCCUCUGUUGUAGUAAAGGGCACUCUUUCUGUCACCUCCUCCGAACUCUAUUUUGAGGUGGAUGAAGAGGAUCCUAACUUCAAAAAAAUCGACCCCAAGUUGCUGUGAUGUUCAACUUCCCAGACCCUGCAACAGUAAAGAAAGUGGUUAACUAUCUACCUCGUGUUGGCGUUGGAACAAGUUUUGGAUUGCCUCAAACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-98.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -108.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 68.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.....(((..(((((((((((...((..((((((((.(((((((((((((.((.(.((((((((((((.....((.(((((......))))))).))).)))....((((((((((...)))))..)))))(((.(((((......))))))))....((((...(((...)))....)))).(((((.(..(((((((................)))))))..))))))((........))....)))))).).))..).)))))))).).))).))))))))....(((....))).(((.(((.....))).))).....))...)))))))))))))).....))(((........)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.....(((,.{((((((((((...((..((((((((.(((((((((((({.((.(.((((((((((({.....(,,(((((......)))))),,))).)))....((((((((((...)))))..}))))((,{(((((......)))))))).,.||||,...,,,{{{.{{{..{(((,.(((((({..(((((((....,,.......,,.)))))))..))))))..)))).}}}.)},..)))))).),)}..),}))))))).),})).))))))))....((,..,,),,.{((.{((,,...}}}.})),,...})...)))))))))))})).....))(((........)))