Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0017300
Sequence Length
707 nt
GC Content
0.3550
GUAAUGCCAUUAUACAUUUCCUGGUCUGUUUUCGAUAAUAUGUCAAGCCAUAAUUAGGUAUUCAUUGAAAAGAGAAAACUCAAGGGUCUAUUCUGAGAUCAGAACAGCUUUCCAUUGUUUAUAUGAUCUAUAUCUAUACCCCAUUAUAACAAUCGGUUAUGAUUACAACCUAGAUUCAUUGAAAAACCCUUGGUUAUAGAAGUCUGCAAGUAGUCUACCAGUGGGUUUCCUUGUCUUUACUCUCUUUCAAUGCUAUUGCAGCCUUCCUAGUACCAUUAUUAAAACCACUUCAUUGAAAAACCUAAGACAUGACAUUCAAGGCUUGUUAGUGCCAUUCCUUAAAUCUUCCUUGCCAUUCAUCUUUUUCGUGCAUCUCUAACCACACCAAGCAACUUGCGAUCCAGACAUACCUUUUAUUUUUUCUUUAUAUUUUCUCAUGCUCUUCUUUGUGUUUUCAGUUCUGUUCCCAUGUUAUCUUCUUGGUGAGUUCCCAUUUGUCUUUCAGAAUCCUUCCGAAAUGUGACUGUGUCCAAGUACUUUAUCAGCCAUUGCCUCUUCUUUCUCUCAGAAGCAUUACUUGGUAGAUAUUUCUUUGCUUAUAUGUGUUCUCAUAGCGUUUGAUAAAUACAAGUAUUAAAGCACUUAUAGUCUGGUACACAUUUUAUUUUUUCCCAGUAUACUAUAAAGUACUUGUAGAGUAGAAGCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-114.97 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -130.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 183.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............((((((((..((((((.....(((((.((((((........((((((.((((.((((..(((....)))((((((...(((..((((((((((((.......))))))...))))))..(((((......((((((((.....)))))))).......))))).....)))..))))))(((..((((((.((((((.((((.....((.((((............)))).))......)))))))))).))).)))..)))..............)))).))))..))))))....))))))....(((........))).................((((.............).)))..........(((((((.(((.((.((..((((......................................................)))).)).)).))).....))))))).........)))))...))))..))....))))))))(((.((..(((((((((((((.((((......(((((.......))))).......)))).))))......(((((((.((((((.(((.......)))..)))))).)))....))))..((((((((((..................))))...))))))))))))))))).)))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.,{{(,,,.....||||,,.,||(((.{{{{{((((({((,(,{........|||,||}||,|}||||}},||,...,,,.,(((({({((({{(((((({{{{((,......,})))}...))))))..{((((......((((((((.....)))))))).......))))},{,.,|||..,,,..((((..((((((.((((({{((((.....((.((((............)))).))......)))))))))).)))},))..)))).............}}}}.}}}|..||,,||{{|{{|{,,..,,,(({......,.}}}...............,.||,,.............|||,,..........{{{{(((.{{{.{{.({..{(({,,.............................|||,........)}}}...,,},,}}).}}.}}.}}}.....)}))))),}....,,,.,|||{{{|,||,...,}}.)))),,,)}},}}}..((((((((,((({.((((.,,,..(((((.......))))),,.....)))),}}}}......{((({{(,((((({.{((.......)))..}})))}.}))},.})))}.{((((((((((..................))))...)))))))))))))))))))))))}.})}}
Back