Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0020200
Sequence Length
583 nt
GC Content
0.4271
AAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAGGCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAGUAUUACAGAGAGGCUUGAACACGCUUUGGAAAAGGCAGCUCCUCUCCUUCGUGAGAUUUUUGUGGAUUUUGCACCUUUUCUUUCUCGGACACUUUUGGGUAGCCAUGGACAAGAACUGCUUAUAGAAGGAACAAGUCUGGUUUGCAUGAAGUCGAGUAGUUCAGUUGUGGAAUUGGUUAUGCUACUGUGUUCUCAGGAGUGGCAAAAUUCUAUUCAGAAGAAUGCAGGCCUUGCUUUUAUCGAACUUGUCAAUGAAGGAAGGUUGCUUAGCCAGACAAUGAAGGAUCAUCUAGUAAGAGUAGCAAAUGAAGCUGAAUUUAUCCUGAGCAGGCAGAGAGCAGAAGAUAUUCACAGACAUGCGGAAUUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -153.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 106.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((((..((......)))))))))..)).)))(.....((((.....((((..((.....(((((((.(.(((((((((((.(((......((....))......)))..)))))).)))))).)))))))((..((((..(((....((((((((((...........((((((((((((...(((((.(((((...((((((((....((((.((((.......(((((....))))))))).)))).....(((((((((....))))))))).....((((((((.((..(((....)))..))..))).))))).))))))))...)))))..((((((((.(((........((((..((((((....))))))...)))).(((((((((...((((((.......))))))...)))))))))(((((.(((((((.((.....)).)))))))))))))))..))))))))......))))).(((....)))........))))))))))))....)))))..)))))...)))..))))..))..))..)))).....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..(((((((..{{......)})))))))..)),,))({,...,,{{.....((((..,,.....(((((((.(.(((((((((((.(((......((....))......)))..))))))))))))).)))))))((..((((..(((....((((((((((........,..((((((((((((...(((((.(((((...((((((((.....((({(({{.......(((((....)))))}}}|}))))|....((((({{{{....)))}}))))..,..|{{{((((.({.,(,,..,{|}}..)),,),,,,)))}.))))))))...)))))..((((((((.(((........((((,.((((((....))))))...}))).(((((((((,..((((((.......)))))).,.)))))))))(((((.(((((((.((.....)).)))))))))))))))..))))))))......))))).{((....}}}..,,....)))))))))))).,..)))))..)))))...)))..))))..))..}}..)))).,.,.}))})
Back