Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0021500
Sequence Length
566 nt
GC Content
0.4276
CAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAGGCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAGUAUUACAGAGAGGCUUGAACACGCUUUGGAAAAGGCAGCUCCUCUCCUUCGUGAGAUUUUUGUGGAUUUUGCACCUUUUCUUUCUCGGACACUUUUGGGUAGCCAUGGACAAGAACUGCUUAUAGAAGGAACAAGUCUGGUUUGCAUGAAGUCGAGUAGUUCAGUUGUGGAAUUGGUUAUGCUACUGUGUUCUCAGGAGUGGCAAAAUUCUAUUCAGAAGAAUGCAGGCCUUGCUUUUAUCGAACUUGUCAAUGAAGGAAGGUUGCUUAGCCAGACAAUGAAGGAUCAUCUAGUAAGAGUAGCAAAUGAAGCUGAAUUUAUCCUGAGCAGGCAGAGAGCAGAAGAUAUUCACAGACAUGCGGAAUUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-138.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -147.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 108.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((.((.(((((((..................................(((((((.(.(((((((((((.(((......((....))......)))..)))))).)))))).)))))))((..((((..(((....((((((((((...........((((((((((((...(((((.(((((...((((((((....((((.((((.......(((((....))))))))).)))).....(((((((((....))))))))).....((((((((.((..(((....)))..))..))).))))).))))))))...)))))..((((((((.(((........((((..((((((....))))))...)))).(((((((((...((((((.......))))))...)))))))))(((((.(((((((.((.....)).)))))))))))))))..))))))))......))))).(((....)))........))))))))))))....)))))..)))))...)))..))))..))..)))).))).)).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,((,((.(((((((....................,{,,,.........{((((((.(.(((((((((((.(((......((....))......)))..))))))}}))))).))))))}((..((((..(((....((((((((((........,..((((((((((((...(((((.(((((...((((((((.....((({(({{.......(((((....)))))}}}|}))))|....((((({{{{....)))}}))))..,..|{{{((((.({.,(,,..,{|}}..)),,),,,,)))}.))))))))...)))))..((((((((.(((........((((,.((((((....))))))...}))).(((((((((,..((((((.......)))))).,.)))))))))(((((.(((((((.((.....)).)))))))))))))))..))))))))......))))).{((....}}}..,,....)))))))))))).,..)))))..)))))...)))..))))..))..)))).))).)},)))...
Back