Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0026500
Sequence Length
1241 nt
GC Content
0.4464
UUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUAGAGGAUAGCAAACAAGCUCAAUUUUUAGCCUUGGCAGUAGUAUACUUUAUCUCUGUUCUUAUGGUCUCCAAGUACAGAGACAUUUUGGAACCCCAAAAUGAAAGGCAUAGCCAGUCAUGUACAGAAACUGGCAGUGAAAAUGAGAAUGUAUCACUCUCUGAAAUCACACCAGCAGCAUUCAGCACUUUAACUACGGCAUCAGUGGAAGAAUCUGAAAGCACAUCAUCUGCUCGAAGGAGGGACUCAGGCAUUGGGGAAGAAACAGCCACUGGUUUAGGAAGCCAUGUGGAAGUAACUCCUCACACAGCACCUCCUGGUGUCAGUGCAGGCCCAGAUGCAAUCAGCGAGGUGCUAUCUACUCUUUCUUUAGAAGUCAAUAAGUCUCCGGAAACCAAAAAUGAUAGAGGAAAUGACUUGGACACUAAGGCUACACCGUCAGUUUCAGUUUCAAAAAACGUCAAUGUGAAAGACAUUCUCCGAAGCUUGGUUAACAUACCAGCAGAUGGAGUCACAGUGGAUCCUGCCCUUCUGCCACCAGCCUGCCUUGGAGCCCUUGGUGAUCUAUCUGUGGAACAACCCGUGCAGUUCAGAUCUUUUGACAGAAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAGGCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAGUAUUACAGAGAGGCUUGAACACGCUUUGGAAAAGGCAGCUCCUCUCCUUCGUGAGAUUUUUGUGGAUUUUGCACCUUUUCUUUCUCGGACACUUUUGGGUAGCCAUGGACAAGAACUGCUUAUAGAAGGAACAAGUCUGGUUUGCAUGAAGUCGAGUAGUUCAGUUGUGGAAUUGGUUAUGCUACUGUGUUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-335.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -359.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((.((..(((((....)))))..)).))...........)))))((((........(((((((..((((((....)))((((...(((((......))))).....))))((.....))(((((.(......).))))).))).)))))))((.((((((...((.((((..(((((((((((((((........(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((((.(((((((((((...((((...))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..)))((((((....((((((((((..((((((((..((............))....(((((((.(((((((.((((((((((.((((.((((.(((.((..((((..((((.((..((..((((((((((...)))))).))))..))............(((((((((((((.....((((........))))))))).))))))))(((((((.((((((((............((....))............)))))))).(((((((((.(((.(((((........))))).)))))))).....))))((((.....)))).(((((..(((.(((......))))))...)))))....))))))).)).))))..))))...))))).)))).))))....))))))........((......))))))..))))))).....((((....))))(((((((..((......))))))))).....)))))))......................))))))))..))))))))))...))).)))...)))))))))........((((((((.........(((.((((...)))).)))....(((((.....((((((.(((((.(((((((((............((((....)))).........))))).)))))).)))))))))..))))))))))))).))))))....))))))))).))))))...)))))).)).((((((....(.(((((((...(((((((((((((.......((((.......))))..........)))))))))..)))).....))))))).)....))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{(((((.((..(((((....)))))..)).))}..,,,},,|||||||((((...(((((((({{(((.((..((.........))..)).)))))))))))){(((((((.{{{(((((,{(({(((.(......}.))))),|{,,{{{|{||.{{{.(((.{{{....}))})}|}}}.}}}...,|||}|..}}}(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((({,(((((((((((...{(({...}})}...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..))),{{,{({,,,((((((((((..((((((((..((.,.........,)}....(((((((.(((((((.(((({((({{.((((.((((.(((.{,..((((..((((.{(..{(..((((((((({...}))))).))))..}}...|||||....(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))),{{{{{{.{{{{{{{||,,,,......,((,,..}}.........,..,,}})))..,|||||{({.(((.{((((.....,,.))))).}))}}},,.....}}}|,(((,,...}},,,(((({..(({{(((......))))))...))))),,,})))))}}.}}.))))..))))...}}))).)))).))))....))))}},,.....,|{......)}))))..)))))))....,{{{{...,||}}(((((((..{(......)})))))))..,,,)))))))..........,,..........))))))))..)))))))))}.,,)),,)),...)))))))))...,,...((((((((.........(((.((((...)))).)))....{((((.....((((((.(((((.(((((((((......,....,((({....}))).......,.)))))},))))).)))))))))..))))}))))))))))))))}))}}))))|||,,...,.)}}.....,...,,.(({{((..,.(.(((((((...(({{({{(({(({.....,}{{,{..,,,,,)))}.,..,,.,},))))))))),,)))),,...}}}}})),)....))))}}})))
Back