Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0028400
Sequence Length
1693 nt
GC Content
0.4371
AUAUCAAGGCAACAUGAGCAGCCAGGGCAAGGAAUAGCACCAGAUGCAGUUAAUGGACAAAGGAGGGAUUCCAGAUCUACUGUGUUUCGUAUUCCUGAGUUCAACUGGUCUCAGAUGCAUCAACGUUUGCUCACUGAUCUAUUAUUUUCAAUAGAAACAGAUAUACAGAUGUGGAGAAGCCAUUCAACAAAGACAGUUAUGGACUUCGUGAAUAGCAGUGAUAAUGUCAUCUUUGUACACAACACAAUUCAUCUCAUCUCUCAAGUGAUGGACAAUAUGGUCAUGGCUUGUGGGGGUAUACUGCCAUUGCUUUCAGCUGCUACAUCGGCUACACAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAGUUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUAGAGGAUAGCAAACAAGCUCAAUUUUUAGCCUUGGCAGUAGUAUACUUUAUCUCUGUUCUUAUGGUCUCCAAGUACAGAGACAUUUUGGAACCCCAAAAUGAAAGGCAUAGCCAGUCAUGUACAGAAACUGGCAGUGAAAAUGAGAAUGUAUCACUCUCUGAAAUCACACCAGCAGCAUUCAGCACUUUAACUACGGCAUCAGUGGAAGAAUCUGAAAGCACAUCAUCUGCUCGAAGGAGGGACUCAGGCAUUGGGGAAGAAACAGCCACUGGUUUAGGAAGCCAUGUGGAAGUAACUCCUCACACAGCACCUCCUGGUGUCAGUGCAGGCCCAGAUGCAAUCAGCGAGGUGCUAUCUACUCUUUCUUUAGAAGUCAAUAAGUCUCCGGAAACCAAAAAUGAUAGAGGAAAUGACUUGGACACUAAGGCUACACCGUCAGUUUCAGUUUCAAAAAACGUCAAUGUGAAAGACAUUCUCCGAAGCUUGGUUAACAUACCAGCAGAUGGAGUCACAGUGGAUCCUGCCCUUCUGCCACCAGCCUGCCUUGGAGCCCUUGGUGAUCUAUCUGUGGAACAACCCGUGCAGUUCAGAUCUUUUGACAGAAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAGGCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAGUAUUACAGAGAGGCUUGAACACGCUUUGGAAAAGGCAGCUCCUCUCCUUCGUGAGAUUUUUGUGGAUUUUGCACCUUUUCUUUCUCGGACACUUUUGGGUAGCCAUGGACAAGAACUGCUUAUAGAAGGAACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-473.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -504.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 348.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((...(((.(.((((..((((((((.(((((((.....(((((((((...((((............)))).....)))))))))..)))))))..)))...)))))))))).))).((.(((((((....(((.((((((......))))))..))).....))))))).))((((((((..(((.......))))))).))))(((.((((..(((((...)))))..)))).)))..(((((...(((((((....(((((.(((..((...))..))).)))))((((((((((((((((((((((((((((......((((...................((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((..(.((((.(((........))).)))).)..))))...))))......)))))))).....(((((..((((.(...((((((.(((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))).((((((((.....)))))).)))))).))))))).)))))))..((.(((....))).))....(((((......)))))....)))).))))))..)))))..))))).)))).))))))))))))))))(((.(((.(((....)))))).)))........(((....)))(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((((.(((((((((((...((((...))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..)))((((((....((((((((((..((((((((..((............))....(((((((.(((((((.((((((((((.((((.((((.(((.((..((((..((((.((..((..((((((((((...)))))).))))..))............(((((((((((((.....((((........))))))))).))))))))(((((((.((((((((............((....))............)))))))).(((((((((.(((.(((((........))))).)))))))).....))))((((.....)))).(((((..(((.(((......))))))...)))))....))))))).)).))))..))))...))))).)))).))))....))))))........((......))))))..))))))).....((((....))))(((((((..((......))))))))).....)))))))......................))))))))..))))))))))...))).)))...)))))))))........((((((((.........(((.((((...)))).)))....(((((.....((((((.(((((.(((((((((............((((....)))).........))))).)))))).)))))))))..)))))))))))))....)))))))..)))))))))(((..(((((((.((((.(..((....(((....)))))..).))))..).....))))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.{((...(((.,.((((..((((((((.(((((({.,...(((((((((...((((....,,,.....)))}..,..))))))))).})))))))..))),..)))))))))}.))).{(.(((((((....(((.((((((......))))))..))).....))))))).}}((((((((..{((.......}}})))).))))(((.(({{.,(((((...})))},,)))).)))..{{{{{...{(((((({{{,(((((.(((,,(,...,},}))).)))))((((((((((((((((((((((((((((.,....((((.,......,,,,|,.....(((((((({{...,,|||...}))}}}}..(((((((((((.....)))))))))))....{(((..|.((({.{((........))}.)))).}..)))}...))))....,.)))))))).....(((((..((((.(...(((((({((,,(((((((..(((((((...((((.(((((.....))))),((((((((.....)))))).)})))).))))))).)))))))..||}{((....))},||{...(((((......)))))....,))),)))))}..)))))..))))).)))).)))))))))))))))),,,||||,{((||..||}}}}}},}|}},....{({....}}}(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((({,(((((((((((...{(({...}})}...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..))),{{,{({{,,((((((((((..((((((((..({.,..........)}....(((((((.(((((((.(((({((({{.((((.((((.(((.{,..((((..((((.{(..{(..((((((((({...}))))).))))..}}...|||||....(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))),{{{{{{.{{{{{,{|},,,,......,((,,..}}.........,..,,}})))..,|||||{({.(((.{((((.....,,.))))).}))}}},,.....}}}|,(((,,...}},},(((({..(({{(((......))))))...))))),},})))))}}.}}.))))..))))...}}))).)))).))))....))))}},,.....,{{......)}))))..)))))))....,{{{{...,||}}(((((((..{(......)})))))))..,,,)))))))..........,,..........))))))))..)))))))))}.,,)),,)),...)))))))))...,,..,((((((((.........(((.((((...)))).)))....{((((.....((((((.(((((.(((((((((......,....,((({....}))).......,.)))))},))))).)))))))))..))))})))))))),,}}}})))}}..}))))))}}{{(..((({(({,((((.(,.{(.,..{{|,,..))}})..),)))}..,,,...})))))..)))
Back