Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0028600
Sequence Length
1380 nt
GC Content
0.4399
CCAUUCAACAAAGACAGUUAUGGACUUCGUGAAUAGCAGUGAUAAUGUCAUCUUUGUACACAACACAAUUCAUCUCAUCUCUCAAGUGAUGGACAAUAUGGUCAUGGCUUGUGGGGGUAUACUGCCAUUGCUUUCAGCUGCUACAUCGGCUACACAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAGUUUGUGCAGUCGCAGUAAGGAAUUGCUUGGAGUGUCAACAGCAUUCACAACUGAAAACUAGGGGAGAUAAAGCCUUGAAACCAAUGCAUAGCCUUAUUCCUUUAGGGAAAUCUGCAGCGAAGAGCCCAGUGGACAUUGUGACUGGCGGUAUAUCUCCAGUAAGAGAUCUUGACAGGCUUCUACAGGACAUGGAUAUUAAUCGGCUUAGGGCAGUUGUUUUCAGAGACAUAGAGGAUAGCAAACAAGCUCAAUUUUUAGCCUUGGCAGUAGUAUACUUUAUCUCUGUUCUUAUGGUCUCCAAGUACAGAGACAUUUUGGAACCCCAAAAUGAAAGGCAUAGCCAGUCAUGUACAGAAACUGGCAGUGAAAAUGAGAAUGUAUCACUCUCUGAAAUCACACCAGCAGCAUUCAGCACUUUAACUACGGCAUCAGUGGAAGAAUCUGAAAGCACAUCAUCUGCUCGAAGGAGGGACUCAGGCAUUGGGGAAGAAACAGCCACUGGUUUAGGAAGCCAUGUGGAAGUAACUCCUCACACAGCACCUCCUGGUGUCAGUGCAGGCCCAGAUGCAAUCAGCGAGGUGCUAUCUACUCUUUCUUUAGAAGUCAAUAAGUCUCCGGAAACCAAAAAUGAUAGAGGAAAUGACUUGGACACUAAGGCUACACCGUCAGUUUCAGUUUCAAAAAACGUCAAUGUGAAAGACAUUCUCCGAAGCUUGGUUAACAUACCAGCAGAUGGAGUCACAGUGGAUCCUGCCCUUCUGCCACCAGCCUGCCUUGGAGCCCUUGGUGAUCUAUCUGUGGAACAACCCGUGCAGUUCAGAUCUUUUGACAGAAGUGUCAUUGUUGCAGCAAAAAAGUCAGCAGUCUCACCUUCCACCUUUAAUACAAGCAUACCUACCAAUGCUGUCAGUGUGGUUUCCUCAGUAGAUUCAGCCCAAGCCUCAGAUAUGGGAGGAGAAUCACCAGGCAGUAGAUCAUCUAAUGCAAAAUUGCCCUCAGUUCCAACAGUUGAUUCAGUUUCACAAGAUCCGGUUUCAAAUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-389.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -415.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 424.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((((((..(((((..(((.(.......).))).)))))....)))))))...................(((((((((((.(((..((...))..))).)))))((((((((((((((((((((((((((((......((((...................((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((..(.((((.(((........))).)))).)..))))...))))......)))))))).....(((((..((((.(...((((((.(((((((((((..(((((((...((((.(((((.....))))).((((((((.....)))))).)))))).))))))).)))))))..((.(((....))).))....(((((......)))))....)))).))))))..)))))..))))).)))).))))))))))))))))...))))))..)))..))(((.((..((((.(((((.......(((((.((((.(((((((((.........)))))))))..(((..((((.(((((((((((...((((...))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..))))))))))..)))((((((....((((((((((..((((((((..((............))....(((((((.(((((((.((((((((((.((((.((((.(((.((..((((..((((.((..((..((((((((((...)))))).))))..))............(((((((((((((.....((((........))))))))).))))))))(((((((.((((((((............((....))............)))))))).(((((((((.(((.(((((........))))).)))))))).....))))((((.....)))).(((((..(((.(((......))))))...)))))....))))))).)).))))..))))...))))).)))).))))....))))))........((......))))))..))))))).....((((....))))(((((((..((......))))))))).....)))))))......................))))))))..))))))))))...))).)))...)))))))))((((...(((((.(((.........(((.((((...)))).))).........)))..)))))....))))..............)))))))))....)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{((,{(,{,{,{{{{{{{{,.||,,{{{,,{{{{{((({{{{|{.,,,,.}|||.|.,..,,,,,.,,,,..,{{{,,.{{{{{,|||{{(.....,})))).)}))){|{{((({{{{{|{|{|||{{{||{{||,|,,..{|||.....,,,||,||}.....((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....,{||,}|,||||}{|(,,|||||,|}|,}}}}.|,,|}}}...,}}}...,|,|||||}},.....{{(((,.((({.({,,(({{({((({{(((((((..(((((((...((((.(((((.....))))),((((((((.....)))))).)})))).))))))).)))))))..||,{((....))},||{...(((((......)))))....,))),}}}}},.,)}}}|,.}}}}}.}}}|,}))}|}}}}})))))),,,|||({((({{,,,||(({,{{{{{{...(((({,,,.,..(((((,(((({(((({((((,,{,.....|||||||||..{((..(((,,((((({(((((...{(({...}})}...(((((((.((..(((...))))).)))))))((((((((....)))))))).)))))...((((((...........))))))..}))))}))))..))),}},}|}}|||||{((((((..((((((((..({.,,....,,...},....||{((((.{((((({.({((,{{{{{.((({.{(((.(((.,..,((({.,((((,,(..((..((((((((({...}))))).))))..))..,}}}}},...(((((((((((((.....((((........))))))))).)))))))),{{{{{{.{{{{{{{{|,,,,......,((,,..}}.........,..},}}))),.,|||||{({.(((.{((((.....,,.))))).}))}}},,.....}}}|,(((,,...}},},(((({..(({{(((......))))))...))))),,,,)))))}},)},))))..))))...}}))).)))).))))...,)))}})}},.,,,}||,.....},))))..))))))),,,,|{{{{...,||}}(((((((..{(......)})))))))..}},}))))))...........|..........})))))))..))))))}|||,{|,||,||,...|||}},))}.....,.}||||}|,}}}}},},.,(((,{{({...}}}}.)))...}})))))},}))))),.,,},))},,,)))))},)))))}),)}|||||,,,,})))
Back