Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0033200

Sequence Length

955 nt

GC Content

0.3958

GUGAUUUUGGUCAGGAGUUUCCACUCUCCCCUAUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUCUUUUUUCUCCCUGAAAUGGUGGUUCUGCUUUCUUGCCAAGGCUGGUGUCAAAAUCCUGGGCUCAAGUGAUCCCGCCUCCUUAUCCUUCCUAGUAGCUGGAAUUAGAGGUGCUCCCCUAUCUCUUUUUGCUCUAAAGUAGUGCUUCUGAAAUUUUAAGGAGAUACAUAAACUUAAGGUGAUUAAAAAACACAAGGUGAUUCAUAAAUUUGAUGAUCUUGUUAAAAUGCAGAUUAGAUUAUAUAGGUCUAGGCUGGGGUGGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCUCUUUGGGAGGCCAAAGUGGGUGGAUCCCCUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCGUCUUUACUAAAAAUACAAAAAUUAACCAGGUGUGGUGGUGCACGCUUAUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGCAGAAUCGCUUGAACCUGGAAGUUGGAGAUUGCAGUGAGCCAAGAUCACACCACUGCACUGCAGCCUGGGCAAUUGAGCGGGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAGGGUUAUAGAGGUCUAGGGUAAGGCCUAAAAUUGACUACCAAGUCCCAGGUGAUGUUGAUGCUGCUUUUCUUACAAACACACUGGAAUAACAACGUUCUAAACUAGCAUCAUUCAAGUACAGCCUUUAUUCAAAAAAGCUGUGGUAAUUUGUUAAUGCAGUUAAUAAAAUCAUGAAAUCUCUGUUCUUCUCCUGGAAACACUUCUUCCCUAAGUAAAAGUAAAAAUACAUGAAAUGACUUUUUAAUGUUAACUGGACUUCUUAGGUGAAGCAAAAAACAAAACAAAAAAACCCUUUUUUGCAUAAUUUUCCUUCUAUAUAGUUGUAAAUAUCGAGACUUUGUUAAAUGAUUUGAUUAUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-263.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -282.01

Frequency: 0.0000

Diversity: 223.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((.((((.((((........))))...((((((((((((((...................(((.((((.((((((((((..(((((.((((((...((((..(((.(((.(((((((((.(.((..(((((.((((((.(((((((((.(((((((((((.(((((((((......((.(((...))).)).((((..(((((((.(((((.(((.........((((...................)))).......)))))))).))))))).)))).((((((.....))))))(((((((((((((.....))))....)))))))))((((((....)))))).(((.(..((((.((.(((((((.(((...)))...)))))))..)).)).))..))))............................))))).)).)).)))).))).)))).))))))))).)))))).)))))..)).).))))))))).))))))..))))....(((((((..............)))))))...)))))).)))))..)))))))))))))).)))))))))))))))))((((((((..((((......)))).....((((....))))(((((.((...((((((((.((...............((((((......)))))))).))))))))....(.((((((.(((......))).)))))).)..(((((((((...)))))))))...................)).)))))........((((((((((...((((......((((((((.....)))).)))).......)))))))))).))))............(((((((....)))))))..........))))))))................)))).....)))).))((((...))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((,((({.(({(,((((,.......))}}.,,({(((((((((((({...........,,,....,||,{{((.((((((((((..(((((.((((((,,.((((..(((.(((.(((((((((.(.((..(((((.((((((.(((((((((.(((((((((((.(((((((((.,,,.,((.({,.,,|}}.}}.((((..(((((((.{{{{{.{{{..{,{{...(({{,,......,{{.,|||.,.|||,.....}}))}))))).))))}}}.)))).((((((.....))))))(((((((((((((.....))))....)))))))))((((((....)))))).(((.(..(({(,{{.(((((((.(({...}))...)))))))..}}.)).))..))))}..,,,,,....................})))).)).)).)))).))).)))).))))))))).)))))).)))))..)).).))))))))).))))))..)))},...(((((((..............)))))))...)))))).)))))..)))))))))))))}.}})))))))))))))),.,,}}((((((......})))))......((((....))))(((((.((.{.((((((((.{{,..............{(((((......))))))}}.))))))))..,,(.((((((.(((......})).)))))).)..{((((((((...))))))))}.....{{.....,....,.)).)))))........((((((((((...((((......(((({(((.....}))).)))).......)))))))))).)))).|,,,,......{{{{{{{....)))))))............,,,{{{.,,.}},....,..}}))}},}},,}}}),))|{||,,,)}}}