Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0033500
Sequence Length
1573 nt
GC Content
0.4024
GUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAGAUAUCAAGGCAACAUGAGCAGCCAGGGCAAGGAAUAGCACCAGAUGCAGUUAAUGGACAAAGGAGGGAUUCCAGAUCUACUGUGUUUCGUAUUCCUGAGUUCAACUGGUCUCAGAUGCAUCAACGUUUGCUCACUGAUCUAUUAUUUUCAAUAGAAACAGAUAUACAGAUGUGGAGAAGCCAUUCAACAAAGACAGUUAUGGACUUCGUGAAUAGCAGUGAUAAUGUCAUCUUUGUACACAACACAAUUCAUCUCAUCUCUCAAGUGAUGGACAAUAUGGUCAUGGCUUGUGGGGGUAUACUGCCAUUGCUUUCAGCUGCUACAUCGGCUACACAUGAACUGGAAAAUAUUGAACCUACUCAAGGCCUUUCAAUAGAAGCCUCUGUGACAUUUUUGCAGAGGCUAAUUAGCCUUGUGGAUGUGCUUAUAUUUGCAAGUUCUCUUGGCUUUACUGAAAUUGAAGCUGAAAAAAGUAUGUCAUCUGGAGGAAUUUUGCGGCAGUGUCUCCGACUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-409.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -440.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 365.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((.......)))))....((((((..................))))))....((((((((.......((((((.((.((((((((((((((....(((..((((.........(((((.(((.((...)).))).)))))((((((..........((...((((((((.((..(((((((((((....))))..(((....))).((((((((......((((((.((((.......))))....)))))).....)).)).)))).((....)).)))))))..)).))..........))))))...))...((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))..((((((.(((((((((((((((...(((((.......((((...)))).....)))))..)).......(((((........(((((.(((..((((....)))).)))..)))))))))).....(((((....((((((.((.((.(((........))).)).)).))))))......)))))..((.(((((((((((((.(((((...(((....))).....)))))............(((((..((.(((.((....)).))).)).))))).......((((((((((((((.(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))).....))))))).((..(((..((.......))..)))..))...............))))))..))))))).)).))))))))))))).))))))..((((....))))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......)))))))).(((((((((....)))))(((.(.((((..((((((((.(((((((.....(((((((((...((((............)))).....)))))))))..)))))))..)))...)))))))))).))).((.(((((((....(((.((((((......))))))..))).....))))))).))((((((((..(((.......))))))).))))(((.((((..(((((...)))))..)))).)))..))))........((((........))))(((......))).))))((((.((((.(((((((((((.(((((((.((((((.((((((.((..............((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....((((..(.((((.(((........))).)))).)..))))..........)).)))))).....))).).)).)))))))))).....)))))))))))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.{((((.......})))}....((((((...,..............))))))....((((((((.,.....((((((.(,{((((((((((((((,...(((..((((.........(((((.{{{.({...}}.}}}.)))))(((((({{{{{,.,.{((,..,|||||}}}},..((((({{((({....}))),,|||...,|||,((((((({..{.,,,((((,.,,||,,.,,..)))}.,.,))))}|,....||.}}.,},}.{{,,...,,}},}}}}...{||{,...,,...}})),}},,.|},|.{(((((.((((((({((...{{{{{{{{..,,,,..{((((((..(((.((..(((..{{{.((((({......}))))).}}}..)))..)).))).))))))}.......,(({{{,.............)))))))}.,,,....,)))))).})))...)))))}..((((((.((((((((((((((({,,{(,(({{,...,(((..,{{|||,,...,{{,,,,{,,,..{({(.((((.(((...(((((.(((..((((....)))).)))..)))))...)))...)))),.)}}}|{{{||,|||{{,{{|,,,{||,..|(((((.....))))).,..{{{{{,{..{,,,..,,,}},,...{((({...(((....))).,,..)))),.,},,,}},...{{{{,..|{.|||,||,,,.)),)))}),.}}}}}{{{{{{{({{{((((((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))))}},,},}})|}|{{,.{((..,{.......))..)))}.)}...,..,,|,...,,.....,)})))))})))).}}))))))))))).))))))..((({....})))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......)))))))).{{{{(((((....)))))(((.|.((((..((((((((.(((((({.,...(((((((((...((((....,,......)))}..,..))))))))).})))))))..))),..)))))))))}.))).{(.(((((((....(((.((((((......))))))..))).....))))))).)}((((((((..{((.......))})))).))))(((.(({(..(((((...}}}},,.)))).)))..,,,..,,}},..((((........))))(((......))).))))((((.((((.((((((((,{,.(((((((,(({{{{.((((((.{,.......,,.....((((((((((.....)))...)))))))..(((((((((((.....)))))))))))....{(((..(.((((.(((........))).)))).)..)))}..........}).))))))....,))}.},}}.))))))),}}.....)))))))))))).)).))
Back