Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0033900
Sequence Length
1265 nt
GC Content
0.3708
AUAUCAAGGCAACAUGAGCAGCCAGGGCAAGGAAUAGCACCAGAUGCAGUUAAUGGACAAAGGAGGGAUUCCAGAUCUACUGUGUUUCGUAUUCCUGAGUUCAACUGGUCUCAGAUGCAUCAACGUUUGCUCACUGAUCUAUUAUUUUCAAUAGAAACAGAUAUACAGAUGUGGAGAAGGUUUGUCUAUAUGUUUAUUAUGGAAGAUGUGUAUAAACCUAGUCUUUAUUUUCAAAGAAAUCCAUAGAAACAGUUUGUAAUUAAUUUCAGACAUUUGGUUAAAAAGUAGAAUAGAAAUUAUUCUAUGGUAGGGUUUUACUGAAUUCACUUUUAUUCUCCAUUAUAAGAAUGGAAUCCUUAUCUGGAUUACAAAAAUGUGAAAAGCAGAGGUUUCUCUUUUAAAAAAAUUUGUAGUAGAUUUCCUGUAGCAAUUUUAUGGCACGGAAUUCACCAGAAGGUAGGUUUAUCAAGUUGGUUUAUUACUAGAAGUAUUAAAAAAUAAUUGGUAUAGGCCGGGCGCAGUUGCUCAAGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAUGCAGGCGGAUCAUAAGGUCAGGAGGUCGAGACCAUCCUGGCUAACACGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAAUUAGCUGGGAGUGGUGGCGGGCGUCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGUAGGAGAAUGGUGUGAACCCGGGAGGUGGCGCUUGCAGUGAGCUGAGACCACGCCACUGCACUCCGGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAUUGUUAUAACAUUAUCAAUAUUUCCAAUGUAUUUUUAGCAUUAAAAAAAAUCUGUGUACUUCAAGUUAUCCCCCAUUGUAUGAUUUAUGAUUUUAAAGUGACCUAAUUUAUUUUUUUUUAUUUGUGUAAGAUUCUUGUUAUGUUUAAAAGCAUUUUAUAGGCAUUACAGAAGAAAAUUCAUUUUUAAUAGCACAUUUACCAGUAUUUACCUCCUAAUUUUUGUCACAUGAUUUCUUAGUUUUGUUCCCAGUAAGGAUAAUUUUCUUCAACUUUUUAUAUCCAGUGUAAAAUGAAUAGUAUUUAUGUUUCAGCACUGAAGGAGGGCAUGGAUAGUAACUACUGAUAUGGAAUGGUCUGUUUCUUCUGAAGAAGUAUACACCCUCCAAAUGCCUGCUGCAUCAUCUUCCUUCAGUUUUCAAGAUGAAGCAAAAGCACCUUCUUAUCUUUCCUCCCCUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-316.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -342.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 361.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.(....).)))......((((..(((((........((((((((....((.((..((((((..((((.((((..(((((((.((....(((((.((....)).)))))..(((........))).......((((((......)))))).))))))))).)))).))))..((((((((.(((((.(((......))).))))).))))))))..(((((......)))))...((((((((..(((((.((.((.((((..(((.....)))...)))).)).)).))))).))))))))(((((((((((((.......(((((((((........))))))))).(((..(((((((((((((......(((((.(((....)))))))).......)))))))).((.((((.((.((.........)))))))).)).))))))))..((((((((.(((((.((((.((((...)))).))))...))))).).)))))))((((......))))..(((((((.((((((....))))))......))))))).........(((((((((((....))).))))))))....)))))))))))))......(((((((((((.......(((((((((.((..(((....)))..)).)))))))))....(((((((.((((.((((...(((((..(((.....))).)))))(((((((.((((....)).))))))))))))).)))).)))(((((((.....))))))).................((((.((......)).))))..))))..)))))))))))..............(((((((((((((((((.(......).)))))))((((....(((((((......)))))))...)))).(.((((((((.(((...........))).)))))))).).....((((((((............((((..(((((..(((((.((((...........((((.((((.((((((............((((((((.....)))))..))).........((((((....((((..((....))..)))))))))).)))))).)))))))))))).))))).....)))))..))))))))))))..))))))))))))))))...)))).)))))))).................((((.(..((....))..).))))....))))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{{.(,,..}.}}}...,,,((((..(((((..,.....((((((((....((.{,..((((((..{(((.(({{.,|{((({{,{{,,,,{((((.,{....)},))))}..(((........)))...,{|.((((({......)))))).,)})},}}}})))),)})},.((((((((.(((((.(((......))).))))).))))))))..(((({......}))))...{{{{{{{{..,((((,{{.,,..{{{,,|||..,,.}}}..,}}||{||{||,}}}}},))))))||(((((((((((((..,.....,,,||||({{{{{...,,))))))|,((,..{{{||((((((((......(((((.(((....)))))))).......)))))))).((.((((.((.,(,......,,}))))))).)),||}}},)),.{{{,{{{({{.,{,.((((.((((...)))).)))}...,,.))))|||||||,((((,....,))))..|||||||.((((({....}))))).{{{..,,,,))).........(((((((((((....))).))))))))....))))))))))))),,....(((((((((({.......(((((((((.((..(((....)))..)).))))))))),,,,(,,,{||}||{{.((((,.,(((((...(({{{{.|||{|,|,,(((((((.((((....)).))))))))))})).,)))})),(((((((.....))))))).................{{{(.{{...,,.}}|}},}.,}}}}..}))))))))))..............{(((((((((,{({{{{....,,,,}.}})},,}}}}}}...,{{{{{|,.....}}}}}}}.,,||,|.|,,|{{|||{.{{{,|,{|||,,|,}}}.}}}}}}))})}}|,.(((((((({..{{{{{{,.,,(({..,{,{(,,{{{{{.,,{({{{{{......,{,,{((,({{(,,,.}}},.}}}....,{,,{|||.....})))}..,,,.........((((((....((((..{{....))..)))))))))).)))))}.},}))}}}))}}.}}))).,,,})))))}.,}})))))))))..))))))))))))))))...}})),)))))))),,,{,.,,,,,......,|||}}}}||....}}..,.,}},.,,,))))).))))...
Back