Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0035100
Sequence Length
2843 nt
GC Content
0.4034
GGUACAUUUAAAUUCAAAGCAGAAAGCGACCUUUUCCUUGCUGAGCAUCACAAACUUUUAUUGUACGAUGGGAAACUCUCUAGUGCCAUUGCAUUCACGUACAAUCCACGGGCUACAGAUGCCCAGCUUUGUCUUGAAUCAUCUCCUAAGGACAACCCUUCAAUUUUUGUUCAUUCACCACAUGCACUCAUGCUCCAGGAUGUAAAGGCAGUUUUAACACAUUCCAUCCAAAGUGCAAUGCAUUCAAUUGGAGGAGUACAAGUACUAUUUCCACUUUUUGCACAGUUGGAUUACAGGCAAUAUUUGUCUGAUGAGAUUGAUUUGACUAUAUGUUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAGGAUUCUGGAGUAAAGGAAGAUGAAUUACAGGCCAUUCUUAAUUACCUACUGACUAUGCAUGAGGAUGACAAUCUAAUGGAUGUCCUACAGCUGCUUGUUGCAUUAAUGUCAGAACACCCUAACUCUAUGAUUCCUGCUUUUGACCAAAGGAAUGGGUUACGUGUUAUCUACAAACUUCUGGCAUCGAAAAGUGAAGGAAUCAGGGUACAAGCUCUUAAGGCAAUGGGUUAUUUUUUAAAACAUCUGGCCCCAAAGAGGAAAGCAGAAGUCAUGCUUGGACAUGGAUUGUUUUCAUUGCUAGCUGAAAGGCUCAUGCUUCAGACAAAUUUAAUCACAAUGACCACAUAUAAUGUGCUGUUUGAGAUUCUUAUAGAACAGAUUGGUACUCAGGUGAUACAUAAACAGCAUCCAGAUCCUGAUUCUUCAGUGAAGAUACAAAACCCUCAGAUACUAAAAGUAAUUGCGACCCUACUUCGAAAUUCUCCCCAGUGCCCAGAGAGCAUGGAGGUUCGCAGAGCCUUUCUUUCUGACAUGAUUAAACUUUUUAAUAACAGUAGAGAAAACAGGAGGAGCUUGCUACAAUGCUCUGUGUGGCAAGAAUGGAUGCUUUCUCUCUGCUAUUUUAAUCCUAAGAAUUCAGAUGAGCAAAAGAUAACAGAAAUGGUAUACGCCAUAUUCAGAAUCCUGCUUUACCAUGCAGUCAAAUAUGAGUGGGGUGGCUGGCGUGUAUGGGUAGACACUUUAUCAAUCACUCAUUCAAAGGUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAGAUAUCAAGGCAACAUGAGCAGCCAGGGCAAGGAAUAGCACCAGAUGCAGUUAAUGGACAAAGGAGGGAUUCCAGAUCUACUGUGUUUCGUAUUCCUGAGUUCAACUGGUCUCAGAUGCAUCAACGUUUGCUCACUGAUCUAUUAUUUUCAAUAGAAACAGAUAUACAGAUGUGGAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-731.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -789.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 777.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.................((.....))..)(((((((....((((((((..........((((((((..((((...)))).(((((....)))))..))))))))....((((.......))))..((((((((((............((((((.((.........((((.(((((....((((((.((((((((((((((.....((.(((..((....(((((.((((((((((...)))))...)))))))))).....))..))).)).......(((..(((((((....(((((.(((.((((....)))).)))))).))....)))))))..)))...((((((((((..(((((((...((((.((((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))..............(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))...)))))...)))))))).(((((.((...((((...((((((......((((((((..(((((((((..(((...((.((...((((.....(((((((..(....)..))).))))......))))...)).))....)))..))))...((((((((................))))))))....)))))..)))))))).)))))).))))..))))))).((....))..(((.(.(....).).)))(((((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))))))....))))))).))))))))))))))))))))).(((((...((((........))))....)).)))..)))...)))))).)))))))))......)).))))))...((((((((((((......(((((..(((((((.(((..((((((((((((((((((((((...(((((........)))))....))).)))..)).))))))..))))))))((((((...(((((..(((.(((..(((.....)))..)))...)))...)))))..(((((.......)))))(((..((((((((((..........((((..(((....))))))).........(((((..(((..((..((..(((.((((..((...))..)))).))).))..))..))).)))))....)))))..)))))..)))((..(((((...)))))..)).......(((.((((...)))).)))(((.......)))............)))))).((..((((((((((((...)))))).....(((((.((..(((....((..((((.(((.(((((((.((.......(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).))))..))...)))..))))))).(((((...(((....((((((((....))))).)))...))).)))))..))))))..))......)))))))))).)))))((((((.((((((...)))))).........((((((((...))))))))))))))........((((((..................))))))....((((((((.......((((((.((.((((((((((((((....(((..((((.........(((((.(((.((...)).))).)))))((((((..........((...((((((((.((..(((((((((((....))))..(((....))).((((((((......((((((.((((.......))))....)))))).....)).)).)))).((....)).)))))))..)).))..........))))))...))...((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))..((((((.(((((((((((((((...(((((.......((((...)))).....)))))..)).......(((((........(((((.(((..((((....)))).)))..)))))))))).....(((((....((((((.((.((.(((........))).)).)).))))))......)))))..((.(((((((((((((.(((((...(((....))).....)))))............(((((..((.(((.((....)).))).)).))))).......((((((((((((((.(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))).....))))))).((..(((..((.......))..)))..))...............))))))..))))))).)).))))))))))))).))))))..((((....))))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......)))))))).....(((((....)))))))))))..)))))))))))))))).........((((.((((...(((((..(((((.((..((((.....))).)..))...)))))..)))))))))))))..))))).)))(((((((....(((.((((((......))))))..))).....))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(......,..........,...,,.}...)(((((((..((((.(((((.....{{...((((((((.{((({...,}}}.{((((....))))},,))))))))....|||.....}}})),)})}.,{(((({({,{,.,{{{,,.(((|||.,||||......(((((((((,,{,.((((((.({,(((((((((((,{,,,{,{{({{{{,....,,{{{,(((((,((((,,.}}}},...,|||||||||,....}}}}.,}}}}|,,..,}|}},,||}))}|..(((((({...|)))))).}}}}}}}}..||{{|.....}})))}|{.,,,.}}((((((((((..((((((({{,((((.((((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....}))))...)))))}||...,,,,,,...(((((((..,.(((((.(((,,.(((({...(((...)))..})))}.....))).....))))),,.)))))))...)))))...)))))))).({{{{,|{|,,({((...((((((......((((((((..(((((...,,,((({{(({,,{,,,(({{..,..(((((((..(....)..))).))))......,,}}......|,...}),}))))))},,((((((((.............,..))))))))....)))))..)))))))).)))))).}}}|||||}}}}}.{{....)).,|,|,|||,,,,}.,.},.(((((.((({{{(((((.......)))))))))).))))))))).}}.))))))).))))))))))))))))))))).{({{{,,,{{{{...,....}}))},..}}.}}}..}}}...)))))).))|}}},,},,,...)},||||||...((((((((((((....,,(((((..((((((,{(((..((((((((((((((((((({((...(((((........)))))....))).)))..))}))))))..))))))))||||.{{.((((((..((((.((((,{{,,,,,,.....{(((({.,{,...,.)|.(((((.......)))))(((..(((({{(({,,,,,,{...,((((..{((....))))))).........{{{{{..||{.,{{,.....|{{,(((({{(,...|}..,}}).}))...,,)).,},}.)))))....}}}})}})))))..)))((..(((((...)))))..},......,}}}}|,,,..,}}}|,{,.(({.......)))..,,,...)))).))))..)))))).}}(((((((...)))))))|{,{(((({.|{,,(((,....,..{(((.(((.(((((((.((.......(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).)))),,}}...},}..,,})))).}}}.....|{,....((((((((....))))).)))...,,,((((........)))).,......)))))))))).)))))||{,{{,((({({...,}}}}}..,}}),,.{(((((((...)))))))}...|||........((((((..................))))))....((((((((.{.....((((((.(,{((((((((((((((,...(((..((((.........(((((.{{{.({...}}.}}}.)))))(((((({{{{{,.,.{((,..,|||||}}}},..((((({{((({....}))),,|||...,|||,(((({(({..{.,,,((((,.,,||,,.,,..)))}...,))))}|,....||.}}.,}}}.{{,,...,,}},}}}}...{||{,...,,...}})),}},,.|},}.{(((((.(((((({{((...{{{{{{{{..,,,,..{((((((..(((.((..(((..{{{.((((({......}))))).}}}..)))..)).))).))))))}.......,(({{{,..,..........)))))))}.,,,.....)))))).})))...)))))}..((((((.((((((((((((((({,,{(,(({{,...,(((..,{{|||,,...,{{,,,,{,,,..{({(.((((.(((...(((((.(((..((((....)))).)))..)))))...)))...)))),.)}}}|{{{||,|||{{,{{|,,,{||,..|(((((.....))))).,..{{{{{,{..{,,,..,,,}},,...{((({...(((....))).,,..)))),.,},,,}},...{{{{{..|{.|||,||,,,.)),)))}),.}}}}}{{{{{{{({{{((((((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))))}},,},}})|}|{{,.{((..,{.......))..)))}.)}...,..,,|,...,,.....,)})))))})))).}}))))))))))).))))))..((({....})))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......)))))))).,}},(((((....))))))))))}.,)))))),)))))},||....{{,..,{{|}||||.,}|||||},||||}}||}}|{||,,...}}},},.}}||,|}}||{{|,||..,,)},))}})}})).,,.(((((((....(((.((((((......))))))..))).....))))))))))))))
Back