Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0035600

Sequence Length

1458 nt

GC Content

0.3985

AUUCUUAUAGAACAGAUUGGUACUCAGGUGAUACAUAAACAGCAUCCAGAUCCUGAUUCUUCAGUGAAGAUACAAAACCCUCAGAUACUAAAAGUAAUUGCGACCCUACUUCGAAAUUCUCCCCAGUGCCCAGAGAGCAUGGAGGUUCGCAGAGCCUUUCUUUCUGACAUGAUUAAACUUUUUAAUAACAGUAGAGAAAACAGGAGGAGCUUGCUACAAUGCUCUGUGUGGCAAGAAUGGAUGCUUUCUCUCUGCUAUUUUAAUCCUAAGAAUUCAGAUGAGCAAAAGAUAACAGAAAUGGUAUACGCCAUAUUCAGAAUCCUGCUUUACCAUGCAGUCAAAUAUGAGUGGGGUGGCUGGCGUGUAUGGGUAGACACUUUAUCAAUCACUCAUUCAAAGGUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-363.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -394.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 401.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((..((((....(((((((...((((...........((((((((..((((((....)))).))...........((((...........((..((((((....(((((.(..(((((...........)))))..).))))))))))).)).((((((((((.....((((((...))))))..))).)))))))....))))..(((((((((........)))))))))..))))))))..(((((((...(((((....)))))...)))).)))............((((((((....))))).)))......((((........))))......((((((((((((.(((.(.......).))).)))).......))))))))(((((((...)))))))..............)))))))))))...)))).))))...((((.(...((((((((.......((((((.((.((((((((((((((....(((..((((.........(((((.(((.((...)).))).)))))((((((..........((...((((((((.((..(((((((((((....))))..(((....))).((((((((......((((((.((((.......))))....)))))).....)).)).)))).((....)).)))))))..)).))..........))))))...))...((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))..((((((.(((((((((((((((...(((((.......((((...)))).....)))))..)).......(((((........(((((.(((..((((....)))).)))..)))))))))).....(((((....((((((.((.((.(((........))).)).)).))))))......)))))..((.(((((((((((((.(((((...(((....))).....)))))............(((((..((.(((.((....)).))).)).))))).......((((((((((((((.(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))).....))))))).((..(((..((.......))..)))..))...............))))))..))))))).)).))))))))))))).))))))..((((....))))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......))))))))...).))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((({.{(((....(((((((...((((,.,.,......{({{{{{{..{{((({..,,||}}.)),},.........,.{,,.((({...}))).,}|(,({{({{({{,,...,,{({{....((((((.(((({{{||{((({{,,.|||||{(((((((({.....(((((,...})))))..}}},}))))}...,))})).}||||||{|,}}}}}}}.)),)))),,..,)))}}||{{(((((((..,(((({....,}))),,.)))).))).,,,.|......((((((((....))))).)))......((((........)))).......,})))))))),)}|||,|||},|,|{|||,,,,}}}}}}..})))}},{(((((((...)))))))}.............}))))))))))...))))})))}...((((.(...((((((((.{.....((((((.(,{((((((((((((((,...(((..((((.........(((((.{{{.({...}}.}}}.)))))(((((({{{{{,.,.{((,..,|||||}}}},..((((({{((({....}))),,|||...,|||,(((({(({..{.,,,((((,.,,||,,.,,..)))}...,))))}|,....||.}}.,}}}.{{,,...,,}},}}}}...{||{,...,,...}})),}},,.|},}.{(((((.(((((({{((...{{{{{{{{..,,,,..{((((((..(((.((..(((..{{{.((((({......}))))).}}}..)))..)).))).))))))}.......,(({{{,..,..........)))))))}.,,,.....)))))).})))...)))))}..((((((.((((((((((((((({,,{(,(({{,...,(((..,{{|||,,...,{{,,,,{,,,..{({(.((((.(((...(((((.(((..((((....)))).)))..)))))...)))...)))),.)}}}|{{{||,|||{{,{{|,,,{||,..|(((((.....))))).,..{{{{{,{..{,,,..,,,}},,...{((({...(((....))).,,..)))),.,},,,}},...{{{{,..|{.|||,||,,,.)),)))}),.}}}}}{{{{{{{({{{((((((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))))}},,},}})|}|{{,.{((..,{.......))..)))}.)}...,..,,|,...,,.....,)})))))})))).}}))))))))))).))))))..((({....})))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).......))))))))...).))))..