Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0035900
Sequence Length
1758 nt
GC Content
0.3987
GAUGACAAUCUAAUGGAUGUCCUACAGCUGCUUGUUGCAUUAAUGUCAGAACACCCUAACUCUAUGAUUCCUGCUUUUGACCAAAGGAAUGGGUUACGUGUUAUCUACAAACUUCUGGCAUCGAAAAGUGAAGGAAUCAGGGUACAAGCUCUUAAGGCAAUGGGUUAUUUUUUAAAACAUCUGGCCCCAAAGAGGAAAGCAGAAGUCAUGCUUGGACAUGGAUUGUUUUCAUUGCUAGCUGAAAGGCUCAUGCUUCAGACAAAUUUAAUCACAAUGACCACAUAUAAUGUGCUGUUUGAGAUUCUUAUAGAACAGAUUGGUACUCAGGUGAUACAUAAACAGCAUCCAGAUCCUGAUUCUUCAGUGAAGAUACAAAACCCUCAGAUACUAAAAGUAAUUGCGACCCUACUUCGAAAUUCUCCCCAGUGCCCAGAGAGCAUGGAGGUUCGCAGAGCCUUUCUUUCUGACAUGAUUAAACUUUUUAAUAACAGUAGAGAAAACAGGAGGAGCUUGCUACAAUGCUCUGUGUGGCAAGAAUGGAUGCUUUCUCUCUGCUAUUUUAAUCCUAAGAAUUCAGAUGAGCAAAAGAUAACAGAAAUGGUAUACGCCAUAUUCAGAAUCCUGCUUUACCAUGCAGUCAAAUAUGAGUGGGGUGGCUGGCGUGUAUGGGUAGACACUUUAUCAAUCACUCAUUCAAAGGUCACUUUUGAAAUACACAAAGAAAACCUUGCCAAUAUAUUUAGGGAACAGCAAGGAAAAGUUGAUGAAGAAAUAGGGCUGUGUUCUUCAACUUCAGUUCAAGCAGCCUCUGGCAUUAGAAGGGAUAUUAAUGUUUCAGUAGGAUCCCAGCAACCAGAUACGAAGGAUUCUCCUGUCUGUCCUCAUUUCACCACAAAUGGUAAUGAAAAUUCAAGUAUAGAGAAGACAAGUUCACUAGAAUCUGCAUCUAAUAUUGAACUGCAAACUACUAAUACAUCUUAUGAAGAAAUGAAAGCUGAGCAAGAAAAUCAGGAGUUACCAGAUGAAGGCACUUUGGAAGAAACACUGACAAAUGAGACAAGGAAUGCAGAUGAUUUAGAAGUAUCUUCUGACAUAAUAGAAGCUGUGGCUAUUUCCUCUAAUUCUUUUAUAACAACUGGCAAAGAUUCAAUGACUGUCAGUGAAGUAACUGCUUCUAUAAGUUCUCCUUCAGAAGAGGAUGCCUCAGAGAUGCCAGAAUUCUUGGAUAAAUCUAUAGUAGAGGAAGAGGAAGAUGAUGAUUAUGUGGAACUGAAAGUAGAAGGCAGUCCUACUGAGGAAGCUAAUCUACCCACAGAGCUCCAAGAUAACAGUUUGUCUCCAGCUGCAUCUGAAGCCGGUGAAAAACUGGACAUGUUUGGUAAUGAUGACAAAUUAAUAUUUCAAGAAGGAAAACCUGUUACUGAAAAGCAAACUGAUACUGAAACUCAAGAUUCUAAAGAUUCUGGAAUUCAGACUAUGACAGCAUCAGGGUCUUCAGCUAUGUCACCAGAAACUACUGUUUCCCAAAUAGCUGUAGAAUCAGACCUUGGUCAGAUGCUGGAGGAAGGGAAGAAAGCAACUAACCUCACUAGAGAAACCAAAUUAAUUAAUGAUUGUCAUGGUAGUGUCUCUGAGGCUUCUUCUGAGCAAAAGAUUGCGAAGUUGGAUGUUUCCAAUGUUGCUACAGAUACUGAGAGGCUGGAGUUGAAGGCCAGUCCCAACGUGGAAGCACCUCAACCUCAUCGACAUGUGCUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-443.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -480.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 463.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((...)))))))((..(((.((.((((((((..(((((((..(((((((.(((..((((((((((((((((((((((...(((((........)))))....))).)))..)).))))))..))))))))((((((...(((((..(((.(((..(((.....)))..)))...)))...)))))..(((((.......)))))(((..((((((((((..........((((..(((....))))))).........(((((..(((..((..((..(((.((((..((...))..)))).))).))..))..))).)))))....)))))..)))))..)))((..(((((...)))))..)).......(((.((((...)))).)))(((.......)))............)))))).((..((((((((((((...)))))).....(((((.((..(((....((..((((.(((.(((((((.((.......(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).))))..))...)))..))))))).(((((...(((....((((((((....))))).)))...))).)))))..))))))..))......)))))))))).)))))))..)))(((.((..((((((((((......((((((((...))))))))..............((((((..................))))))....)))))))))).....((((((.((.((((((((((((((....(((..((((.........(((((.(((.((...)).))).)))))((((((..........((...((((((((.((..(((((((((((....))))..(((....))).((((((((......((((((.((((.......))))....)))))).....)).)).)))).((....)).)))))))..)).))..........))))))...))...((((((.((((((((((...((((((((........(((((((..(((.((..(((..(((.((((((......)))))).)))..)))..)).))).)))))))........((.....))..........)))))))).........)))))).))))...))))))..((((((.(((((((((((((((...(((((.......((((...)))).....)))))..)).......(((((........(((((.(((..((((....)))).)))..)))))))))).....(((((....((((((.((.((.(((........))).)).)).))))))......)))))..((.(((((((((((((.(((((...(((....))).....)))))............(((((..((.(((.((....)).))).)).))))).......((((((((((((((.(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))).....))))))).((..(((..((.......))..)))..))...............))))))..))))))).)).))))))))))))).))))))..((((....))))...((((((....)))))))))))).))))..)))...))))))))))))))))))))))....(((....))).)).)))....))))).)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,((({.((,...))})))),,.,,((((({{{{{((((..{((((((..(((((({{(((,.((((((((((((((((((({((...(((((........)))))....))).)))..))}))))))..))))))))||||.{{.((((((..((((.((((,{{,,,,,,.....{(((({.,{,...,.)|.(((((.......)))))(((..(((({{(({|,,,,,{...,((((..{((....))))))).........{{({{..||{.,({,.....|{{,(((({{(,...|}..,}}).}))...,,)).,}}}.)))))....}}}})}})))))..)))((..(((((...)))))..},.....,,}}}}|,,,..,}}}|,|,.(({.......)))..,,,,,.)))).))))..)))))).}}(((((((...))))))){{{{(((((.,{.,(((,...,{..{(((.(((.(((((((.((.......(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).)))),,}}...}}}..}}))))).}}}.....|{,....((((((((....))))).)))...,,,((((........)))).,......)))))))))).))))))),,)))|}}}}...((((((((((......((((((((...))))))))..............((((((...,..............))))))....)))))))))).....((((((.(,{((((((((((((((,...(((..((((.........(((((.{{{.({...}}.}}}.)))))(((((({{{{{,.,.{((,..,|||||}}}},..((((({{((({....}))),,|||...,|||,(((({(({..{.,,,((((,.,,||,,.,,..)))}...,))))}|,....||.}}.,}}}.{{,,...,,}},}}}}...{||{,...,,...}})),}},,.|},}.{(((((.(((((({{((...{{{{{{{{..,,,,..{((((((..(((.((..(((..{{{.((((({......}))))).}}}..)))..)).))).))))))}.......,(({{{,.............)))))))}.,,,.....)))))).})))...)))))}..((((((.((((((((((((((({,,{(,(({{,...,(((..,{{|||,,...,{{,,,,{,,,..{({(.((((.(((...(((((.(((..((((....)))).)))..)))))...)))...)))),.)}}}|{{{||,|||{{,{{|,,,{||,..|(((((.....))))).,..{{{{{,{..{,,,..,,,}},,...{((({...(((....))).,,..)))),.,},,,}},...{{{{{..|{.|||,||,,,.)),)))}),.}}}}}{{{{{{{({{{((((((((((,(((((((.......(((((....)))))....))))))).......))))))))}},,},}})|}|{{,.{((..,{.......))..)))}.)}...,..,,|,...,,.....,)})))))})))).}}))))))))))).))))))..((({....})))...((((((....)))))))))))).))))..)))...)))))))))))))))))))))),...|{|....)}){{{{{.{.({{....}}).).)))))
Back