Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0036700
Sequence Length
1407 nt
GC Content
0.4030
GAUGUAAAGGCAGUUUUAACACAUUCCAUCCAAAGUGCAAUGCAUUCAAUUGGAGGAGUACAAGUACUAUUUCCACUUUUUGCACAGUUGGAUUACAGGCAAUAUUUGUCUGAUGAGAUUGAUUUGACUAUAUGUUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAGGAUUCUGGAGUAAAGGAAGAUGAAUUACAGGCCAUUCUUAAUUACCUACUGACUAUGCAUGAGGAUGACAAUCUAAUGGAUGUCCUACAGCUGCUUGUUGCAUUAAUGUCAGAACACCCUAACUCUAUGAUUCCUGCUUUUGACCAAAGGAAUGGGUUACGUGUUAUCUACAAACUUCUGGCAUCGAAAAGUGAAGGAAUCAGGGUACAAGCUCUUAAGGCAAUGGGUUAUUUUUUAAAACAUCUGGCCCCAAAGAGGAAAGCAGAAGUCAUGCUUGGACAUGGAUUGUUUUCAUUGCUAGCUGAAAGGCUCAUGCUUCAGACAAAUUUAAUCACAAUGACCACAUAUAAUGUGCUGUUUGAGAUUCUUAUAGAACAGAUUGGUACUCAGGUGAUACAUAAACAGCAUCCAGAUCCUGAUUCUUCAGUGAAGAUACAAAACCCUCAGAUACUAAAAGUAAUUGCGACCCUACUUCGAAAUUCUCCCCAGUGCCCAGAGAGCAUGGAGGUUCGCAGAGCCUUUCUUUCUGACAUGAUUAAACUUUUUAAUAACAGUAGAGAAAACAGGAGGAGCUUGCUACAAUGCUCUGUGUGGCAAGAAUGGAUGCUUUCUCUCUGCUAUUUUAAUCCUAAGAAUUCAGAUGAGCAAAAGAUAACAGAAAUGGUAUACGCCAUAUUCAGAAUCCUGCUUUACCAUGCAGUCAAAUAUGAGUGGGGUGGCUGGCGUGUAUGGGUAGACACUUUAUCAAUCACUCAUUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-352.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -383.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 471.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((.((..(((((((((((...(((((.((((......((((((((((....)))).)))))).....))))((((.((....(((((((...))))))).(((((.((.((((....(((.(((.......((((((((((((((..(((((((...((((.((((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))..............(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))...)))))...)))))))).(((((.((...((((...((((((......((((((((..(((((((((..(((...((.((...((((.....(((((((..(....)..))).))))......))))...)).))....)))..))))...((((((((................))))))))....)))))..)))))))).)))))).))))..))))))).((....))..(((.(.(....).).)))(((((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))))))....))))))).))))))))))...)))).......))).))).....)))).)).)))))....)).))))....)))))..)))))..........))))))..)).)))))))).))))))).(((((((..(((((((.(((..((((((((((((((((((((((...(((((........)))))....))).)))..)).))))))..))))))))((((((...(((((..(((.(((..(((.....)))..)))...)))...)))))..(((((.......)))))(((..((((((((((..........((((..(((....))))))).........(((((..(((..((..((..(((.((((..((...))..)))).))).))..))..))).)))))....)))))..)))))..)))((..(((((...)))))..)).......(((.((((...)))).)))(((.......)))............)))))).((..((((((((((((...)))))).....(((((.((..(((....((..((((.(((.(((((((.((.......(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).))))..))...)))..))))))).(((((...(((....((((((((....))))).)))...))).)))))..))))))..))......)))))))))).)))))))(.((((((.((...........)))))))).)....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((({.{{..{{({{((((((({,(((({,.|}},,....((((({((((....}))).}))))).,,.,||||}{{||||,|{{(((((((,{{|||||||,{{{({{(({.{(((,.....|||}}|((,{{{,||((((({.((,..,,,||,|||}|...,}}}}|,}}},|||||.||||}}}.}}}}))))}|(({{{{|,.((((((((((....((({{{{...(((((((..,,((({{,,..((((({(((...{((({...{((...)))..}}}}}....{|||{{...,)),))}},,|||,,..}))|||,,..))},,||{(.,,,}}}|,{((((..,((((({......((((((((..(((((...,,,((({{((,,,{,,,({{{..,..(((((((..(....)..))).))))......,,}}......|,...}),}))))))},,((((((((.............,..))))))))....)))))..)))))))).}}}}}|.|,.((((({{{|,.({....))....)}}},})))),,,,,.(((((.(((({{(((((.......)))))))))).)))))..{((((({....))))))),)}))))}},,,)))....)))))))...}}}.)))).,,))))}})))))..}}||}}.}))}||}||||,.,,,||,..,)))))),.}}.)))))))).})))))}.{{(((((..,(((({.,{{{..{(((((((((((((((((({((...(((((........)))))....))).)))..))}))))))..))))))))})}}.,{.((((((..((({.((((,{{,,,,,......{{{{{|,|{,...,.}|.(((((.....,.))))}(({,,(((({{{{||||,,,,...,((((..{((....))))))).........{((((..|{{.,({,.....{{{,((((,,(,...|}..}}}).}))...,,)).,}}}.)))))....,}}}))})))))..))){{..(((((...)))))..},.....,,}||,|,,,...})}},|,,({(.....,.}}}..,,,.,.}}}}.})))..}})})).}|(((((((...))))))}{{,||||||,||,{((({,...,,,|||{.{((.((((({{.{(....,..(((((((((........)))))))))......)).)))))))))).}}||||}},,.,,},,,,,})}},|||.....{{{....({{(((((....})))).}}}....,,((((........))}}.,......)))))))))),))))))}|,||||||.||....},,}}..}}}))))).,....
Back