Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0039700

Sequence Length

672 nt

GC Content

0.4152

UUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAGGAUUCUGGAGUAAAGGAAGAUGAAUUACAGGCCAUUCUUAAUUACCUACUGACUAUGCAUGAGGAUGACAAUCUAAUGGAUGUCCUACAGCUGCUUGUUGCAUUAAUGUCAGAACACCCUAACUCUAUGAUUCCUGCUUUUGACCAAAGGAAUGGGUUACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-158.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -174.13

Frequency: 0.0000

Diversity: 194.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(((((((..((((((((((..(((((((...((((.((((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))..............(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))...)))))...)))))))).(((((.((...((((...((((((......((((((((..(((((((((..(((...((.((...((((.....(((((((..(....)..))).))))......))))...)).))....)))..))))...((((((((................))))))))....)))))..)))))))).)))))).))))..))))))).((....))..(((.(.(....).).)))(((((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))))))....))))))).)))))))))).......))).))))....))))(...((.((((((((...........(((.((.(((..((((....)))).))).)))))...((((.....)))).......(((((((((..................)).)))))))...)))))))).))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{,{,(((,,,,{,((((((((((..((((((({(,((((.((((((((..(((((.((((........)))).{((((((({{(,,..|}}}}...})))}}|{...,,,}},...(((((((..,.(((((.(((,,.(((({...(((...)))..})))).....))).....))))),,.)))))))...)))))...)))))))).({{{{,|{|,,({((...((((((......((((((((..(((((...,,,((({{(({,,{,,,({{{..,..(((((((..(....)..))).))))......,,}}.....,|,.,.}},}))))))}.,((((((((.............,..))))))))....)))))..)))))))).)))))).}}}|||||}}}}}.{{....))..,,|,|||,,,,}.,.},,(((((.((({{{(((((.......)))))))))).))))))))).}},})))))).))))))))))..,,{{{||{..{||,,{,||,,{...{{,,,|||}}}..,,.,,..{((((.,{((,{{(((({,,{,,{{,..,)}}))))}}.}}}}{{{....,))).....))))),....}}}.}}}}},.,|{{{{{............)))))))))))..}