Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRBA_0039800

Sequence Length

1520 nt

GC Content

0.4013

GCUAUUGCAUUACCUCCUAUAGCCAAAUGGCCAUACCAGAAUGGUUUUACAUUUCAUACAUGGCUUAGAAUGGAUCCUGUAAAUAACAUCAAUGUAGAUAAGGAUAAACCAUAUUUGUAUUGUUUCAGAACCAGCAAAGGUCUUGGCUAUUCUGCUCAUUUUGUUGGAGGCUGUUUGAUUGUAACAUCAAUAAAGUCAAAAGGAAAAGGCUUUCAACACUGUGUGAAAUUUGAUUUCAAGCCACAAAAGUGGUAUAUGGUUACCAUAGUACACAUCUAUAACCGAUGGAAGAAUAGUGAACUUCGAUGUUAUGUGAAUGGUGAGCUGGCUUCCUAUGGAGAGAUAACAUGGUUUGUCAACACUAGCGAUACCUUUGACAAAUGUUUCCUGGGCUCAUCAGAAACAGCAGAUGCUAAUAGAGUAUUCUGUGGUCAGAUGACUGCAGUUUACCUUUUCAGUGAAGCUCUAAAUGCAGCUCAGAUAUUUGCUAUUUAUCAGUUGGGCCUGGGAUACAAGGGUACAUUUAAAUUCAAAGCAGAAAGCGACCUUUUCCUUGCUGAGCAUCACAAACUUUUAUUGUACGAUGGGAAACUCUCUAGUGCCAUUGCAUUCACGUACAAUCCACGGGCUACAGAUGCCCAGCUUUGUCUUGAAUCAUCUCCUAAGGACAACCCUUCAAUUUUUGUUCAUUCACCACAUGCACUCAUGCUCCAGGAUGUAAAGGCAGUUUUAACACAUUCCAUCCAAAGUGCAAUGCAUUCAAUUGGAGGAGUACAAGUACUAUUUCCACUUUUUGCACAGUUGGAUUACAGGCAAUAUUUGUCUGAUGAGAUUGAUUUGACUAUAUGUUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAGGAUUCUGGAGUAAAGGAAGAUGAAUUACAGGCCAUUCUUAAUUACCUACUGACUAUGCAUGAGGAUGACAAUCUAAUGGAUGUCCUACAGCUGCUUGUUGCAUUAAUGUCAGAACACCCUAACUCUAUGAUUCCUGCUUUUGACCAAAGGAAUGGGUUACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-391.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -424.14

Frequency: 0.0000

Diversity: 367.77

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.............)))))(....((((((....(((((......))))).....)))))).(((((((..(((((((....((((((((((((((.((.....)).)))))))))).(((((((((((((((.(((...(((......)))(((..(((((((((((.(((((((.............))))))).......)))))))))))..)))((((((...)))))).(((((....))))).(((((...))))).....((((.......))))(((.((((((.((..(((((.(((((.(((((((((((((.((((((..((((.((...(((((((((((((...((....))...)))))))))((.(((((((((((....(((.((((((((((...((.(((..((((((((....))))))))..))))).........(((((.....).)))).)).)))))))).)))......))))))))))).)).((((...((((((...((((((....(((((........))))).................((((((((..((((...)))).(((((....)))))..))))))))....((((.......)))).))))))..))))))....))))..((((((...........))))))........))))...))...)))))))).....)).))))))..)).))))))((((((.((((((..........((((((((((....)))).))))))....))))))..))))))..(((((((...))))))))))).))))).)).))))).).))).))))))))))((((((((((..(((((((...((((.((((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))..............(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))...)))))...)))))))).(((((.((...((((...((((((......((((((((..(((((((((..(((...((.((...((((.....(((((((..(....)..))).))))......))))...)).))....)))..))))...((((((((................))))))))....)))))..)))))))).)))))).))))..))))))).((....))..(((.(.(....).).)))(((((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))))))....))))))).)))))))))).))))))))........))))..))))))))))))))..........(((((...((.(((((((....((((...))))))))).))))(((.....))).....))))).......((((((....((((((............)))))))))))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.............)))))(....((((((....(((((......))))).....)))))).(((((((..(((((((....{{,(((((((((((.((.....)).)))))))))}|,((((({,(((((((((((...,((,.,,,,|||{{{..(((((((((((.{((((((.............)))))},.......)))))))))))..||}((((((...}))))).(((((....)))))...,({{{{,}|||{....{,{||,|}}|,}}||(({{,{{{{{.{{,,{{{{{.{{{{{,{(({({{{{((((.({{{(,.{({{{.{{...|||{{{((((({{...,{,...}},,.))))))}}|((.(((((((((((.{.{(((.((((((((({.,.((.(((..((((((((....))))))))..))))).,,.,,|(,{((({.....).)))))},.)))))))).})}.}}.}.))))))))))).))|{{{{|........,,,|,,|||}|||||}||,}}}},,,}}||||.{{{{{..,..,,...((((((((.{((({...,,}}.{((((....))))},,))))))))....||{{....,,,))}),))}}}}|||}}},|,,{{{{{{.|||||||,}}},.......}|},,........}}}}....}.||||||||||,....}|.}|||}},.,}.}}}}}|{(((((.(((({{.,.,......((((({((({....}))).})))))....})))))..)))))}..(((((({...})))))),))),))))}.}|{||,,,..,)))}))}})))}))((((((((((..((((((({(,((((.((((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....}))))...)))))}||....,.,,....(((((((..,.(((((.(((,,.(((({...(((...)))..})))).....))).....))))),,.)))))))...)))))...)))))))).({({(.,(|,,({((...((((((......((((((((..(((((...,,,((({{((,,,{,,,((({..,..(((((((..(....)..))).))))......,}}}......|,...}),}))))))},,((((((((.............,..))))))))....)))))..)))))))).)))))).))}},|||}}))).{{....)).,|||,{||,,..,.,.},,(((((.((({{{(((((.......)))))))))).))))))))).}}.))))))).)))))))))),)))))))),,.,,,..)))),.))))))))))))))..........(((((.,{((,(((((({,,{,,{{,...)}}))))}}.}}}}{{|....,))).....))))).......{((({(....((((((............)))))))))))}.)