Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0041100
Sequence Length
2248 nt
GC Content
0.4293
AGGGAAACUUGGAGGCUGCGACCAGGGUUUGGCGUUGUUGUCAGCCUCGGGGAGAGAGAUUGGACAAAUAUUCUCCAAGAGGAGGAGGGCGACGCCAAGGACUUUCCACAUCAACUGCUUUGGGGUAUCUCCACAAGUUGGAAGAGGGACCCUUUCGUUUUGCAUUGCGUGUGUUGUGCUCAUUACCAGUGCAGCGACUGCCGUCCCAGGGUGACUCUGAGUUGUCCUUUAUCGUGAGCUAGCAAUGGCUAGCGAAGACAAUCGUGUCCCUUCCCCGCCACCAACAGGUGAUGACGGGGGAGGUGGAGGGAGAGAAGAAACCCCUACUGAAGGGGGUGCAUUGUCUCUGAAACCAGGGCUCCCCAUCAGGGGCAUCAGAAUGAAAUUUGCCGUGUUGACCGGUUUGGUUGAAGUUGGAGAAGUAUCCAAUAGGGAUAUUGUAGAAACUGUCUUUAACCUGUUGGUAGGAGGACAGUUUGAUCUGGAAAUGAAUUUCAUUAUCCAAGAAGGUGAGAGUAUUAACUGCAUGGUGGACCUACUGGAAAAAUGUGACAUUACGUGCCAAGCAGAAGUCUGGAGCAUGUUUACAGCCAUUCUGAAGAAAAGCAUACGGAAUCUUCAAGUCUGCACUGAAGUAGGCCUUGUUGAAAAAGUGCUUGGGAAAAUUGAAAAAGUUGACAAUAUGAUAGCAGAUCUUUUGGUUGACAUGUUGGGAGUGCUGGCUAGCUAUAAUUUGACAGUUCGCGAGCUAAAGCUUUUCUUCAGUAAACUUCAAGGAGAUAAAGGACGAUGGCCUCCACAUGCUGGGAAGUUGCUGUCUGUGUUAAAGCAUAUGCCUCAGAAGUAUGGUCCUGAUGCCUUUUUUAACUUUCCAGGAAAGAGUGCUGCAGCUAUUGCAUUACCUCCUAUAGCCAAAUGGCCAUACCAGAAUGGUUUUACAUUUCAUACAUGGCUUAGAAUGGAUCCUGUAAAUAACAUCAAUGUAGAUAAGGAUAAACCAUAUUUGUAUUGUUUCAGAACCAGCAAAGGUCUUGGCUAUUCUGCUCAUUUUGUUGGAGGCUGUUUGAUUGUAACAUCAAUAAAGUCAAAAGGAAAAGGCUUUCAACACUGUGUGAAAUUUGAUUUCAAGCCACAAAAGUGGUAUAUGGUUACCAUAGUACACAUCUAUAACCGAUGGAAGAAUAGUGAACUUCGAUGUUAUGUGAAUGGUGAGCUGGCUUCCUAUGGAGAGAUAACAUGGUUUGUCAACACUAGCGAUACCUUUGACAAAUGUUUCCUGGGCUCAUCAGAAACAGCAGAUGCUAAUAGAGUAUUCUGUGGUCAGAUGACUGCAGUUUACCUUUUCAGUGAAGCUCUAAAUGCAGCUCAGAUAUUUGCUAUUUAUCAGUUGGGCCUGGGAUACAAGGGUACAUUUAAAUUCAAAGCAGAAAGCGACCUUUUCCUUGCUGAGCAUCACAAACUUUUAUUGUACGAUGGGAAACUCUCUAGUGCCAUUGCAUUCACGUACAAUCCACGGGCUACAGAUGCCCAGCUUUGUCUUGAAUCAUCUCCUAAGGACAACCCUUCAAUUUUUGUUCAUUCACCACAUGCACUCAUGCUCCAGGAUGUAAAGGCAGUUUUAACACAUUCCAUCCAAAGUGCAAUGCAUUCAAUUGGAGGAGUACAAGUACUAUUUCCACUUUUUGCACAGUUGGAUUACAGGCAAUAUUUGUCUGAUGAGAUUGAUUUGACUAUAUGUUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-670.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -711.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 424.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((.(....)..)))))..(((((((((((.((..((((..((((((..(((.....))).))))))..))))..)).)))))))))))(((...)))((((((((...((((((((....(((((((((((((((((((((......(((((....(((((((((.........(((((.(((((((((....((((((.(((.......((((((((((((((((((((..(((((((((((...((((....))))((((((((((((((....))))..).))))))))).....(((((.((...((((((......))))))...)).))))).....(((.((((((((.((..((((.............)))).)).)).(((((..((((.(...((.((.(((((((.....)))))))....(((((((((((.(((....)))..)))))))))))..(((((((((((...))))).))).)))...............)).))...).)))).)))))...((((...))))(((((.(((.((((((((((...((((((..((((..(((.......((((((......((..(((((((((......))))).))))..))....)))))).........)))...))))..))))))....)))).)))))).))).))))).)))))).))))))))))))....))..)))))))((((....))))(((((.((....))..))))))))))))))))))........))).)))))))))))))))))).))...)))))))))..)))))....))))......)))))))))))))(((((.....((((((.((((...(((((......(((.((((((((((((((......)))))....)))).......)))))))).(((((((((.......(((....))).....)))))...))))....((((((((((((.(((......))).((.((((((((..(((((.(((((((((((.(((((((.............))))))).......))))))))))).....((((((...)))))).(((((....)))))....(((((...(((.......))))))))))))).)))))))).))((((((((((((((..(((.(((.(((((((((..((((.((((((....(((((((((...((....))...)))))))))((.(((((((((((....(((.((((((((((...((.(((..((((((((....))))))))..))))).........(((((.....).)))).)).)))))))).)))......))))))))))).))..((((........))))..(((((((((....)))))...))))((((((((.........((((((((((((((........(.((((.((((((((.............((((.......))))((..(((((((.............)))))))..)).....................((((....)))).....)))))))).)))).).........)))))))....)))))))(((......((((((((((....)))).)))))).....)))..(((((((((((((((((...))))))).......))))))))))....(((.(((((((((((((........)).......(((((((..(((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))..............(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))...)))))...)))))))(((....))))))))))..(((((........)))))......)))).))))))).))))))))))).....)))))).)))).))).......))).)))))).)))))))))))....))))))..))))))))))))........)))))...)))).))))))....)))))...(((.(((...))))))..))))....))))))))..((((((.(.(....).).))))))...(((((.(((((.......))))))))))))))))))(((((((....))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{{{.(((((.{....)..))))).{(((((((((((.((..((((..((((((..(((.....))).))))))..))))..)).)))))))))))|,,.,})))((((((((..,((((((((....((((,{{{{({{(({((((((...,,.(((((....(((((((((..,......{{(((.(((((((((....((((((.(((.......((((((((((((((((((((..(((((((((((...((((....))))((((((((((((((....))))..).))))))))).....(((((.((...((((((......))))))...)).)))))....,(((.(((((({{.({,.((((,,.....,,....)))).)}.)),(((((..((((.(...((.((.(((((((.....)))))))....(((((((((((.(((....)))..)))))))))))..{((((((((((...))))).)))},)}...,,......,...)).))...).)))).)))))...,{{{...}},,(((((.(((.((((((((((..,((((((..((((..(((.......((((((......((..(((((((((......)))))},)))..))....)))))).........))}...))))..)))))).,..)))).)))))).))).))))).)))))).)))))))))))}...,))..))))))){(((....)))}{((((.{{....,}..})))))))))))))))))........))).)))))))))))))))))),)}...)))))))))..))))),.,.))))},,,.,|}}}}}}}}|||,(((((....,((((((.((((...(((((......(((.(((((,((((((({.,,...|||}}....}}}},......)))))})).(((((((((.,...,.{{,....})),..,.)))))...))))....((((((((((({.(((......))).{(.((((((((.,{(((,.(((((((((((.{((((((.............)))))),.......)))))))))))..|||((((({...}))))).(((((....)))))....(({{{..|{{{....,..}}}}}}}}})))}.)))))))).)}(((((((((((((({.,((.(({,(((((((((..((((.((((((....{((((((((...,{....}}...))))))))|((.(((((((((((.{.{(((.((((((((({.,.((.(((..((((((((....))))))))..))))).,,.,,|(,{((({.....).)))))},.)))))))).})}.}}.}.))))))))))).)),.{{{{........,}}}..{(({{{{((....,}))),.,))))((((((((.........{(((((((((((((........{,((({.{{||||{{.,|,||||.....((((.......)))).,..||||{,{(({{,,,,,,..,{((,,,,.}}},.......}}}}},.......,,,({,..,,))}....))))))}}.)))).}.........))))))).,..))))}}|{{{......((((({((((....)))).}))))).....))),.{{{{||{{{{(((((({...}))))))..,,,,.)))))))))}....(((.((((((((((({(........}}.......(((((((.{(((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....}))))...)))))}||....,,,,....(((((((..,.(((((.(((,,.(((({...(((...)))..})))).....))).....))))),,.)))))))...)))))...)))))))|,{....}}})))))))..{((((........))))}......))))},)))))).))))))))))).....)))))).)))).))),......})).)))))}.)))))))))))....))))))..})))))))))))........)))))...)))).)))))).,,.))))).,,|{,{(((...))))},..)))).,,.)))))))),}((((((.(.{....).}.))))))...((({{{(((((.......))))))))))))))))))(((((((....))))))).....
Back