Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0041300
Sequence Length
843 nt
GC Content
0.4116
GGUACAUUUAAAUUCAAAGCAGAAAGCGACCUUUUCCUUGCUGAGCAUCACAAACUUUUAUUGUACGAUGGGAAACUCUCUAGUGCCAUUGCAUUCACGUACAAUCCACGGGCUACAGAUGCCCAGCUUUGUCUUGAAUCAUCUCCUAAGGACAACCCUUCAAUUUUUGUUCAUUCACCACAUGCACUCAUGCUCCAGGAUGUAAAGGCAGUUUUAACACAUUCCAUCCAAAGUGCAAUGCAUUCAAUUGGAGGAGUACAAGUACUAUUUCCACUUUUUGCACAGUUGGAUUACAGGCAAUAUUUGUCUGAUGAGAUUGAUUUGACUAUAUGUUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAGAUGGACCGCGACCUAAUCAAAAAGAAAUGCUUUCUCUACGAGCAUUCUUGUUGAUGUUCAUUAAGCAAUUAGUGAUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-203.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -222.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 264.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((........((((((.((((((((.((.....)))))((((.(((((.....((...((((((((..((((...)))).(((((....)))))..))))))))....))......))))).))))))))).))))))....(((...)))..)))(((((......(((((((.....((((....))))....(((((((((.(((((.........(((((.((((((((((...)))))...)))))))))).((((((((...((((((........)).))))...(((((((...)))))))((((((((.....((((...........((((((((((((((.((......)).))))).........)))).))))).((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))....)))).....))))))))....((...))))))))))....)))))))))))))).......((((((....)).))))..(((....)))(((....))).....(((((.((...((((...((((((......((((((((..(((((((((..(((...((.((...((((.....(((((((..(....)..))).))))......))))...)).))....)))..))))...((((((((................))))))))....)))))..)))))))).)))))).))))..))))))).((....))....))))))).........(((((.(((((.(((((.......)))))))))).)))))..(((((((....))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.........,,,,,,({,({(((.,,..,,,},,}}((((.(((((.....{{...((((((((.{((({...,,}}.{((((....))))},,))))))))....|||,....}}})),)})),,||{{||||,,....,,...})))}})))(((((......{{{{,,{,,,,,,,{(({....|}|,,.{{((((({{{(((({,........{{(((.((((((((((...)))))...))))))))||.((((((({...{({{({........}}|}))},,,(((((((...|}))))},{{{({(({,.,,(({,....,|||||,({{{{{{{{({{{{.{{.,,...}}.}}}}},,,.||||||||}.|||||.||||,,,.,,,})))),{(((((((({(....}))))...)))))}|,..,}}}.....,|||||||,...{{,||}|}))))))),|...})))))))))}}}.......,|||||,...})})}},,,|||,,..}))|||....))),,}|,{||{{||{|,,({((...((((((......((((((((..(((((..,,,{((({{(({,{{,,,({{{.....(((((((..(....}..))).))))......,,}}.....,|,...}),}))))))}.,((((((((.............,..))))))))....)))))..)))))))).}))))).))}},|}}}}}}}.{{....)),,,,))})})},,.......(((((.(((({{(((((.......)))))))))).)))))..(((((((....))))))))))))
Back