Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRBA_0041800
Sequence Length
763 nt
GC Content
0.4155
GGUACAUUUAAAUUCAAAGCAGAAAGCGACCUUUUCCUUGCUGAGCAUCACAAACUUUUAUUGUACGAUGGGAAACUCUCUAGUGCCAUUGCAUUCACGUACAAUCCACGGGCUACAGAUGCCCAGCUUUGUCUUGAAUCAUCUCCUAAGGACAACCCUUCAAUUUUUGUUCAUUCACCACAUGCACUCAUGCUCCAGGAUGUAAAGGCAGUUUUAACACAUUCCAUCCAAAGUGCAAUGCAUUCAAUUGGAGGAGUACAAGUACUAUUUCCACUUUUUGCACAGUUGGAUUACAGGCAAUAUUUGUCUGAUGAGAUUGAUUUGACUAUAUGUUCAACCUUGCUGGCCUUUAUCAUGGAAUUGUUGAAGAACUCAAUUGCUAUGCAGGAACAGAUGCUUGCCUGUAAGGGCUUCUUGGUAAUAGGAUAUAGCCUUGAAAAGUCUUCCAAAUCUCAUGUUAGCAGAGCAGUACUUGAACUUUGCCUUGCAUUUUCAAAAUAUCUGAGUAAUCUGCAGAAUGGGAUGCCCCUGCUCAAGCAAUUGUGUGAUCACGUUCUUCUUAAUCCUGCCAUAUGGAUUCAUACCCCAGCCAAGGUUCAACUGAUGCUCUAUACUUAUCUGUCCACGGAAUUCAUUGGUACAGUCAACAUAUAUAACACCAUUCGGAGAGUUGGAACAGUGCUUCUCAUCAUGCACACGCUGAAGUACUACUACUGGGCAGUGAAUCCUCAGGAUCGAAGUGGUAUCACCCCAAAAGGAUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-181.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -198.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 239.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.................((.....))..)((..(((((...((((((((.........((((((((((((((........(.((((.((((((((.............((((.......))))((..(((((((.............)))))))..)).....................((((....)))).....)))))))).)))).).........)))))))....)))))))(((......((((((((((....)))).)))))).....)))..(((((((((((((((((...))))))).......))))))))))....(((.(((((((((((((........)).......(((((((..(((((((..(((((.((((........)))).(((((((((((....)))))...))))))..............(((((((....(((((.(((...(((((...(((...)))..))))).....))).....)))))...)))))))...)))))...)))))))(((....))))))))))..(((((........)))))......)))).))))))).))))))))))).(((((..((.((((..(((.(((((((...((((..............((((((...))).)))...((((((((................))))))))...))))..))))))))))...)))).))...)))))........)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{...,,,............,}},}..,)|(,.(((((((((((((............((((((((.{((({...,,}}.{((((....))))},,)))))))}....((((.......)))),|..{((({{({{,..........}||}}}}..}}........,|,,,,..,....,,{({{....|}|,..{{((((({{{(((({,........{{(((.((((((((((...)))))...))))))))||.((((((((...((({((........}}||))}.,,(((((((.,,||||}}}{{{{({((,,.,,(((,....,{||||{({{({{({((({({.({.,,...}}.}}}}}....}}||,|}}}.|||||.||||,,,.,,}}))))}|((((((({{(,,..}))))...)))))}|,..}}}}.....}}}|||}|,...{{,|}}})))))))),},.,})))))))))}}}.......{|||||,...})}))}},,|||,...}))))))),}))}.,|{.(((((.{(,..((((...((((((......((((((((..(((((..,{,{((({{{({,{{,{,({{{.....(((((((..(....}..))).))))......,,},.....,|,.,.}},})))))),.,((((((((.............,..))))))))....)))))..)))))))).)))))).)))),}}})))))..,,.}))))..))
Back