Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0002400
Sequence Length
625 nt
GC Content
0.3968
ACCUGUCGCGAAAUCGCCUUUCAGAAAUUCCUAUAGAAGCAUGUCACUUUGUUUCUCUGGAAAAUCUCAACUUGUACCAAAAUUGUAUUCGUUAUAUUCCAGAGGCAAUUUUAAACCUACAAGCUCUAACAUUCUUAAAUAUUAGUCGGAACCAACUGUCAACAUUGCCGGUACACUUGUGUAAUUUGCCAUUGAAAGUCUUAAUUGCUAGUAAUAACAAAUUGGUGUCACUUCCAGAAGAAAUUGGACACCUUAGACAUUUGAUGGAACUUGAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-116.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -130.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 195.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((..(((....)))....)))...........((((((........))))))(((((((.((...(((..((((.......))))..))))).)))))))((((((((......((((((((......(((((((((((..((.(((..............(((((.(((((.(((((((.....((((((((.((((......................((((((..(((.....)))....))))))..)))).)))))))).....((.((((..((((.(((........(((.(((....((((..(((((((((..((((((.((.(.....((((((...((.......))..))))))..))).))).)))..))).))))))))))....)))))).....)))))))...................(((((((....((..((...))..)).)))))))(((......)))...............)))).)).)))))))...)))))....)))))..)))))))))))))......)))......))))))))))))))))...(((((...)))))....((((((.(((........)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{{(..(((....)))....}}}...,{{{.,.{((((((........))))))|{{||||.,{...{{(..((({.,...,,)}}}..}}},,.}}}}})){(({{{{{|.....|{((((({......{{{{{{{{{{{.,((,(({.,,..|{{{{..(,((((({(({((,{{{{{((,..,.((((((((.((((...,{,.,,....,,.},....((((((..{((.....)}}...,))))))..)))).))))))))...,||,.|||.},|||}}||,........,,,,(((....,,,,..|||{{,(((,,(({{((,((.{..,,,{(((((....{.......}}..)))))},{|||,|}}.||}.,}||,||||||,,}}....))),,)}}}},})},)),...........,,,.....,{,{{{{,,,{||..,,}},)),,...,,,}..}||,......}}},,,,}.,........,,.},},.|}}|}|}...)))},....)))},.})}}}}}))))}}}......)}}......)))))))))))))))},,,|{|{|,,.)))}}.,)}||||{|,|{|,,,||,,.)))})))))
Back