Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0002500
Sequence Length
719 nt
GC Content
0.4061
ACCUGUCGCGAAAUCGCCUUUCAGAAAUUCCUAUAGAAGCAUGUCACUUUGUUUCUCUGGAAAAUCUCAACUUGUACCAAAAUUGUAUUCGUUAUAUUCCAGAGGCAAUUUUAAACCUACAAGCUCUAACAUUCUUAAAUAUUAGUCGGAACCAACUGUCAACAUUGCCGGUACACUUGUGUAAUUUGCCAUUGAAAGUCUUAAUUGCUAGUAAUAACAAAUUGGUGUCACUUCCAGAAGAAAUUGGACACCUUAGACAUUUGAUGGAACUUGAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUGCCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-155.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -168.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 133.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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