Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0002900
Sequence Length
1328 nt
GC Content
0.4405
ACCUGUCGCGAAAUCGCCUUUCAGAAAUUCCUAUAGAAGCAUGUCACUUUGUUUCUCUGGAAAAUCUCAACUUGUACCAAAAUUGUAUUCGUUAUAUUCCAGAGGCAAUUUUAAACCUACAAGCUCUAACAUUCUUAAAUAUUAGUCGGAACCAACUGUCAACAUUGCCGGUACACUUGUGUAAUUUGCCAUUGAAAGUCUUAAUUGCUAGUAAUAACAAAUUGGUGUCACUUCCAGAAGAAAUUGGACACCUUAGACAUUUGAUGGAACUUGAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUGCCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAACCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAGUGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-331.84 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -357.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 263.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((.(...((((.((.((...((((...(((((((........)))))))..))))..((((..((((((..((((((((..((...........)).)))))))).....)))))).....................(.(((......))).)..((((((.(((.(((.....(((.((.((((((((.((((......................((((((..(((.....)))....))))))..)))).)))))))))).)))..))).))))))))).........(((.(((....((((..(((((((((..((((((.((.(.....((((((...((.......))..))))))..))).))).)))..))).))))))))))....)))))).((((((((((.............((.((((((.((((((((................................)))))))).(((((...((((((.(((..(((....))).....)))....((((((((.........((((..((((....((.(((.((((......))))))).))..)))).))))(((((....)))))((((....))))(((((..(((...(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))...))))))))...))))))...)).))).)))))).))........((((((.((((((.((((.((((((((((........((....))........))).)))))))...................((((.((.(((((.......))))).))...)))).....((((((...)))))).........((((((((.......((((..((((((((..((.((.((..((((..(((......))).....(((...(((((..((.........))..)))))...)))(((.(((((.(((.((((.((..((...))..)))))).)))))))).)))..........((((((......))))))...........)))))))).))..))).))))))))).(((.(((.......))).)))..)))))))).....)))).)))))).))))))......(((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).))))))))...)))))))))))))).....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((...............)))))))))........(((....))).)).)).))))....).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((.{..,((((.,(,((,..((((...(((((((........)))))))..))))..|||,..((((((..((((((((.{((...........)),)))))))).....)))))).,{{,,...,.........,,{.{{{......}}}.}..((((({,(((.(((.....({{.,,.((((((((.((((...,,,.,,....,,.},,...((((((..{((.....)}}...,))))))..)))).)))))))),,.}}},.))).))))))))).........{{{.{{{....({{{..(((((((((..((((((.((.(.,...((((((....(.......}}..)))))).,))).))).)))..))).))))))})))..,.)))))).((((((((((.............({.((((((.((((((((((..,.,,.{,...,....,.,,.....,,..)))))))}.(((((...((((((.{,({,({{....))).....,}),...((((((((..,......((((,.{{((....({.{{,{((((......)))))}}.}).,||||.||||(({((,...}}}},||||,,,,)}))|||{{..{{{...(((((..((((....)).)).))))).}))),}))}),..)))))))).,.))))))...)).))).)))))).))...,,.,.((((((.((((((.((((.((((((((((........{{.....,........))).)))))))....,,.,,.,,,......({{(.{{.(((((.......))))).))}}.||||....,{(((((...)))))),.,,.,...((((((((....{{,((((..((((((((..((.((.({..((((..(((......))).....,(({({((,....(({..({{{...{,,||,,,...||.((({(((,...}}}||})).}}.}}...)))},,))),})))))),}|||,........,.{(((((......))))))...........)))))))).))..))).))))))))),|||.{{{.......}}}.,,...)))))))).....)))).)))))).))))))...}..(((.(((((.(((.((((.,.(((...}})}))))).))).))))))))...))))))))))}}}}.....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((....,.....,....)))))))))........(((....))).,,.)).)))).,..}.)))).
Back