Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0003000
Sequence Length
1382 nt
GC Content
0.4443
ACCUGUCGCGAAAUCGCCUUUCAGAAAUUCCUAUAGAAGCAUGUCACUUUGUUUCUCUGGAAAAUCUCAACUUGUACCAAAAUUGUAUUCGUUAUAUUCCAGAGGCAAUUUUAAACCUACAAGCUCUAACAUUCUUAAAUAUUAGUCGGAACCAACUGUCAACAUUGCCGGUACACUUGUGUAAUUUGCCAUUGAAAGUCUUAAUUGCUAGUAAUAACAAAUUGGUGUCACUUCCAGAAGAAAUUGGACACCUUAGACAUUUGAUGGAACUUGAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUGCCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAACCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAGUGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAGUGCCCCUUCCCAUCCAGAAGGUCUCAGCACACUGAUGAUAGUGCCUUGUGCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-348.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -374.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 333.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((....))).....(((..((((...(((((((........)))))))..))))..)))...((((((..((((((((..((...........)).)))))))).....))))))..................(((((.((((((..((((...((((((.(((.(((.....(((.((.((((((((.((((......................((((((..(((.....)))....))))))..)))).)))))))))).)))..))).))))))))).........(((.(((....((((..(((((((((..((((((.((.(.....((((((...((.......))..))))))..))).))).)))..))).))))))))))....)))))).((((((((((................(((((....(((.((...(((((.(((.(((..((.(((((...((((((.....((((((.......(((..((.(((....))).))..)))....((((((((.........((((..((((....((.(((.((((......))))))).))..)))).))))(((((....)))))((((....))))(((((..(((...(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))...)))))))).(((((.........((((.(((.......))).(((((..........))))).((((((((((........((....))........))).)))))))...))))...........))))).((.(((((.......))))).))..)))))).....))))))....))))).)).......(..((((...))))..)...)))..))))))))..)).)))...))))).............(((...(((((..((.........))..)))))...)))(((.(((((.(((.((((.((..((...))..)))))).)))))))).)))...........).)))))))))..............)))))))))).)))))(((((((((((((((...(((....(((.........(((((((.....))))..)))...((((......))))((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).)))))))))))))...)))))).)).....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((...............)))))))))........(((....)))...)))))))...(((((.(((.....))).)))))..))))))(...(((((...((....))....)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.{{(((....))).....(((..((((...(((((((........)))))))..))))..)))...((((((..((((((((.{((...........)),)))))))).....))))))..................{((((.((((((..{(({...((((({{(((.(((....,{{{.,,.((((((((.((((...,,,.,,....,,.},,...((((((..{((.....)}}...,))))))..)))).)))))))),,.}}}|,))).))))))))).........{{{.(((....((({..(((((((((..((((((.((.(.,...((((((....(.......}}..)))))).,))).))).)))..))).))))))})))....)))))).((((((((({................((((((.{,((((({{(.{((((.(((.{({..,{.{{(((...{{{(({.....{(((((...{{{{((,,,({,(({....))).....}})....((((((((..,......((((,.{{((....{{.{{,{((((......)))))}}.}}.,||||.||||(({((,...}}}},||||,,,,)}))|||{{..{{{...(((((..((((....)).)).))))).}))),}))}),..)))))))).|,))))}}...,,.|||{}|||,..,,..}}}.((((({{...,|||.,}|||.((((((((((........{{.....,........))).)))))))...|||,...,,.......||||.{{.(((((.......))))),))}}}))))}....,|})}}}..,,))))).}}.....,,(.,((({...})}}.,|..,|}}.,|}}}}|}|,.|,..||,,..(((......))).....{((,{{({.....,,|,,,|||.,.,.,|,.,,.,,((.(((((((....))}}}))).)).}}...,)),))))).},)))))}||||,........,.,|,|||}}}}}},,,,}}.,,,,...}}}))))))).))))}((({((||{{{{{((,,.(((....{{,.,,......|||||||,....,))),.)))},.{{{{.,....)}}|((.(((((.(((.((((.,.(((...},),))))).))).))))))))}}})),,,)))))).)}.....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((....,.....,....)))))))))........{((....)))...,))))))...(((((.(((.....}))})))))..}}))))(...(((((,,{.....,)}....)))))..)
Back