Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRCH3_0004600

Sequence Length

574 nt

GC Content

0.4216

UCGGAACCAACUGUCAACAUUGCCGGUACACUUGUGUAAUUUGCCAUUGAAAGUCUUAAUUGCUAGUAAUAACAAAUUGGUGUCACUUCCAGAAGAAAUUGGACACCUUAGACAUUUGAUGGAACUUGAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUGCCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-123.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -136.60

Frequency: 0.0000

Diversity: 152.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((........((((.......((((((.(((((((((((((.((((((((.((((......................((((((..(((.....)))....))))))..)))).)))))))).((.....))....((((.(((........(((.(((....((((..(((((((((..((((((.((.(.....((((((...((.......))..))))))..))).))).)))..))).))))))))))....)))))).....)))))))...)))))).))))).........)))))))).......))))........)))(((((((.(((.....((((((((.....(((..((.(((....))).))..)))....((((((((.........((((..((((....((.(((.((((......))))))).))..)))).))))(((((....)))))((((....))))(((((..(((...(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))...)))))))).))))))....))....)))))))..)).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((({...,...{{,,..|||||||||(.((,{((((((((((.((((((((.((((..,{{{..,....,..,,....((((((..{((.....)}}...,))))))..)))).))))))))..,,,,..}}}.},|||}}||,........,{,.(((....((({..(((((((((..((((((.((.(.,...((((((....(.......}}..)))))).|))).))).)))..))).)))))),)))....)))})),,}}.)))})))...,})))),,)))}{{{{{{.{{{{{{{|||....,,.}},.......,.}}}{{,{||,.||}}}}},.(((((...((((((.{,({,({{....))).....,})....((((((((..,......((((,.{{((....({.{{,{((((......)))))}}.}).,||||.||||(({((,...}}}},||||,,,,)}))||{{{..{{{...(((((..((((....)).)).))))).}))),}))}),..)))))))).,.))))))...)).))),))))),.)).}