Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0004800
Sequence Length
695 nt
GC Content
0.4273
UCGGAACCAACUGUCAACAUUGCCGGUACACUUGUGUAAUUUGCCAUUGAAAGUCUUAAUUGCUAGUAAUAACAAAUUGGUGUCACUUCCAGAAGAAAUUGGACACCUUAGACAUUUGAUGGAACUUGAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUGCCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAACCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-155.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -170.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 148.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((...((((((((((((.(((.(((.....(((.((.((((((((.((((......................((((((..(((.....)))....))))))..)))).)))))))))).)))..))).)))))))))..........................(((((((((..((((((.((.(.....((((((...((.......))..))))))..))).))).)))..))).)))))).)))))).)))).))(.........................(((((((((((((((.((((.(((..(.(((...(((.(((......(((....)))((((((.....(((..((.(((....))).))..)))....((((((((.........((((..((((....((.(((.((((......))))))).))..)))).))))(((((....)))))((((....))))(((((..(((...(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))...)))))))).))))))......))).)))))))..))).....(((((..........))))).((((((((((........((....))........))).)))))))...(((.((............))))).)))).)..))))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((......{(((((((.(((((((((.(,({((.(((,.,,.((((((((.((((...,{,.,,....,,.,,....((((((..{((.....)}}...,))))))..)))).))))))))...,|,..}}}.},|||||||{........,{,.{{{....{{{,..(((((((((..((((((.((.(.,...((((((....(.......}}..)))))).,))).))).)))..))).)))))),))).,}.))))})},||,}}}}}}}.....,|||,,,{{.((((((.((((((((((..,.,,.|,........,..,.....},..)))))))).(((((...((((((.{,({{({{....))).....,,),...((((((((..,......((((,.{{((....({.{{,{((((......)))))}}.}).,||||.||||(({((,...}}}},||||,,,,)}))||{{{..{{{...(((((..((((....)).)).))))).}))),}))}),..)))))))).,.))))))...)).))).)))))).}}......(((((,,....,,..})))).((((((((((........{{.....,........))).)))))))...,,,.,}}}}}}}.,.,},.,))))))))))))))......))){...)
Back