Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0006000
Sequence Length
794 nt
GC Content
0.4458
GAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUGCCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAACCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAGUGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-186.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -202.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.................(((.(((....((((..(((((((((..((((((.((.(.....((((((...((.......))..))))))..))).))).)))..))).))))))))))....)))))).((((((((((................(((((....(((.((...(((((.(((.(((..((.(((((...((((((.....((((((.......(((..((.(((....))).))..)))....((((((((.........((((..((((....((.(((.((((......))))))).))..)))).))))(((((....)))))((((....))))(((((..(((...(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))...)))))))).(((((.........((((.(((.......))).(((((..........))))).((((((((((........((....))........))).)))))))...))))...........))))).((.(((((.......))))).))..)))))).....))))))....))))).)).......(..((((...))))..)...)))..))))))))..)).)))...))))).............(((...(((((..((.........))..)))))...)))(((.(((((.(((.((((.((..((...))..)))))).)))))))).)))...........).)))))))))...)))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({......,{,...,},..(((.(((....((((..(((((((((..((((((.((.(.,...((((((....(.......}}..)))))).,))).))).)))..))).))))))})))....)))))).(((((((((,................((((((.,.(((((.{{.(((((.(((.(((..{{.(((((...((((((.....((((((.,.,{{{((,,.({,(({....))).....}})....((((((((..,......((((,.{{((....{{.{{,{((((......)))))}}.}}.,||||.||||(({((,...}}}},||||,,,,)}))|||{{..{({...(((((..((((....)).)).))))).}))),}))}),..)))))))).|,|||}}}......{(((,{((.......))}.(((((,,....,,..})))).((((((((((........{{.....,........))).)))))))...|}},...........,||||.|{.(((((.......))))),))}})))))).....))))))....))))).}}.......{..((((...))))..}...)))..))))))))..,,..,,....(((......)))..,,.(((.{{(,.....,,}}}.}}},,....,,.,,.,,((.(((((((....))))}))).)).}}....)).))))).,.))))))|{{{{......,.,,.}.)))))))))...}))))))).......
Back