Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0006100
Sequence Length
846 nt
GC Content
0.4504
GAUGUGAGCUGCAAUGAAAUUCAAACUAUACCUUCCCAAAUUGGUAACCUGGAGGCCUUGAGAGACCUUAAUGUAAGAAGAAAUCACCUAGUACAUUUGCCUGAAGAGCUGGCGGAGUUGCCUUUGAUACGGUUAGACUUCUCAUGCAAUAAAAUUACCACAAUCCCUGUUUGUUAUCGGAACCUCAGGCACCUACAGACGAUCACCCUAGAUAACAAUCCACUACAAUCACCUCCUGCACAGAUAUGUAUAAAAGGCAAAGUCCACAUAUUUAAAUACCUGAACAUACAAGCUUGUAAGAUUGCUCCAGAUCUGCCGGAUUAUGAUAGGAGACCGUUGGGUUUUGGCUCCUGCCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAACCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAGUGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-202.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -217.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((..(((..(((........(((.(((....((((..(((((((((..((((((.((.(.....((((((...((.......))..))))))..))).))).)))..))).))))))))))....)))))).....................((((..(((((((((((((((.((((.(((..(.(((...(((.(((......(((....)))((((((.....(((..((.(((....))).))..)))....((((((((.........((((..((((....((.(((.((((......))))))).))..)))).))))(((((....)))))((((....))))(((((..(((...(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))...)))))))).))))))......))).)))))))..))).....(((((..........))))).((((((((((........((....))........))).)))))))...(((.((............))))).)))).)..))))))))))).))))))).....((((((...)))))).........(((((((((...)))).((((((...(((..((.((.((..((((..(((......))).....(((...(((((..((.........))..)))))...)))(((.(((((.(((.((((.((..((...))..)))))).)))))))).)))..........((((((......))))))...........)))))))).))..))).))))))...)))))....))))))..))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((..(((..(({........(({.(((....((({..(((((((((..((((((.((.(.,...((((((....(.......}}..)))))).,))).))).)))..))).))))))})))....))))))...,.|||{{...........((((..((((((((((((((,.(,,{.{{{,,{.{{{...(((.(((...,,.(({....}}}(((({{..,..(({..((.(((....))).,,..)))....((((((((..,......((((,.{{((....{{.{{,{((((......)))))}}.}).,||||.||||(({((,...}}}},||||,,,,)}))|||{{..{{{...(((((..((((....)).)).))))).}))),}))}),..)))))))).)})))),,....))).)))}))}..}}}.,,..(((((,,....,,..})))).((((((((((........{{.....,........))).)))))))...{{{.,(,{,,,,........})}.})))}),,))))))))))).)))))))....,{(((((...)))))},.......,|{||||||{...)}}|{((,,((((((((..((.((.({.,((((..(((......))).....,(((({((,....(({..({{{...{,{||,,,...||.((({(((,...|}}|||)}.}}.}}...))}},,))),})))))),}|||,........,.((((((......))))))...........)))))))).)),.))).)))))))))))}),.....,,)))..))))).....
Back