Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0010100
Sequence Length
643 nt
GC Content
0.4790
CCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAACCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAGUGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-173.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -183.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....((((((.(((((..((((....)).)).)))))((((((((......((((((((((((((((((.(((.(((((((....(((.....(((((.(..(((((..(((((((((((((((........((....))........))).))))))....(((.((............))))).(((((.......))))))))))).)))))..).)))))..)))..))))))).........((((...)))).((((((...(((..((.((.((..((((..(((......))).....(((...(((((..((.........))..)))))...)))(((.(((((.(((.((((.((..((...))..)))))).)))))))).)))..........((((((......))))))...........)))))))).))..))).))))))))).)))))))..................)))))).))))))).)))))).((((......))))((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).)))))))))))))))).)...((.(((...(((((..((((..((....))..)))))))))....))).))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,({,,,.,((({{.(((((..((((....)).)).))))){{|||{||,,....(((((((((((,{((((....{.(((((((....(((.||..(((((.(..(((((..(((((((((((((((........{{....,,........))).)))))),...(((.({............,,))).(((((.......))))))))))).)))))..).))))),.)))..))))))}....{{{.((((....{{(((((,.((((((((..((.((.((..((((..(((......))).....,(((({((,....(({..({{{...{,{||,,,...||.((({(((,...|}}|||}}.}}.}},..))}},,))),})))))),}|||,........,.((((((......))))))...........)))))))).))..))).))))))))}})))......)}})..))),,.,})})))))).)))))}}.}}))},.((((.,.,..}}}|((.(((((.(((.((((.,.(((...,,),))))).))).))))))))}}}}},)),)},,((.(({...(((((..((((..((....))..)))))))))....))).))...
Back