Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRCH3_0010500

Sequence Length

1105 nt

GC Content

0.4805

CCAUGAAGAACUGUACUCAAGUCGCCCUUAUGGAGCCCUUGAUUCAGGCUUCAAUAGUGUGGACAGUGGUGAUAAGAGAUGGUCAGGGAAUGAACCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAGUGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAGUGCCCCUUCCCAUCCAGAAGGUCUCAGCACACUGAUGAUAGUGCCUUGUGCAUGUCGCUGUCAGGGUUGAAUCAAGUGGGCUGUGCUGCUACCCUGCCUCAUUCUUCUGCCUUCACGCCUCUUAAGAGUGAUGACAGACCUAAUGCUCUAUUAAGUUCACCUGCAACAGAAACAGUUCAUCAUUCCCCUGCAUAUUCUUUUCCUGCUGCUAUCCAGAGAAAUCAGCCUCAGCGCCCUGAAAGCUUCCUUUUCCGAGCAGGUGUCAGGGCAGAAACCAACAAAGGUCAUGCUUCACCCCUUCCUCCAUCUGCUGCACCUACCACUGAUUCUACAGAUUCCAUAACAGGACAGAAUUCAAGACAGAGAGAAGAAGAGCUGGAAUUAAUAGACCAACUGCGUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-314.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -335.58

Frequency: 0.0000

Diversity: 198.63

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((((..(((...(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))....((((((((((((((...((((((((..((((..((((....(((((..........))))).((((((((((........((....))........))).)))))))..(((.((((..(((((((.....((((((((.......)))))((.((((((((((.((.((((...(((...((((..(((((..((......(((((((((...(((((.(.((((((((((((((...((...(((((.((((((....((.(((((.....((((..(((((..(((.((.(((((((....)).))))).))......((((...((((((.((((((.............((((((......))))))...........((((....((((.......(((((((((...(((....(((.........(((((((.....))))..)))...((((......))))((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).)))))))))))))...)))))).)))....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((...............))))))))).......)))))))))))))).)))))).....))))..((((.(((((.......))))).....)))).))).))))).))))))))).))...)))))).)))))...))...)))))))).))..))))).))))).)))))))))((((((((((....)).))).))).)).......)))))))..))))...)))...))))..))))))..)))))))))))...)))))))..))))))).....(((........)))...(((((((..((((.(((....))).)))).)))))))....(((......))).....)))).))))....)))))).)).....))))))))..))))))(((((((.............(((......)))...........)))))))...................

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(((((..(((.,.(((((..((((....)).)).)))))..))).)))))....((((((((((((((...((((((((..((((..((({.,..(((((,,....,,..})))).((((((((((........,,.....,........))).)))))))..(({{((((..(((((((..{{,({,(((((.......)))))((.((((((((((.{{.((((...(((...((((..(((((,,{{.{,...(((((((((...(((((.(.((((((((((((((...((...(((((.((((((....((.(({{(.....{{{,..{{{||,,|.,.((.(((((((....)))))))).)).||,..{{{{...((((((.((((((,{{........}}|(((((......)))))}...,,....{{((((...(((((((((.(((({((,,((((..,,..{{((..,.........}|||,.....))))..|||...((((......)))),,.{|||,..,,.(((,...}}|)).))))))))))))).),,)))))),.,,.,,,}|,}|.,......(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((....,.....,....))))))))).........,,,,}})))))).)))))).....)))),,{|||.(((((.......))))).,{{{|,,,.))),.||||,|||,}}))),)),,,)))))).)))))...))...)))))))).)).,})))).))))).))))))))){,(((({,{(,....),))).})}.}}......}),)))))..)))).,.)))...))))..}}))))..)))))))))))...)))))))..))))))).....(((........)))...(((((((..((((.(((....))).)))).)))))))....(((......)))...,.)))).))))....)))))).)).....))))))))..))))))...(((......))}.....{((......,.,.........,,|||,,|,...,..}},.}},......