Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0011800
Sequence Length
735 nt
GC Content
0.4912
CCUACAGAUGAAUUUUCAGAUCUGCCUCUUCGAGUAGCAGAGAUUACUAAAGAACAAAGACUACGAAGAGAAAGCCAGUACCAAGAGAACCGCGGCAGUUUGGUAGUAACAAACGGCGGAGUGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAGUGCCCCUUCCCAUCCAGAAGGUCUCAGCACACUGAUGAUAGUGCCUUGUGCAUGUCGCUGUCAGGGUUGAAUCAAGUGGGCUGUGCUGCUACCCUGCCUCAUUCUUCUGCCUUCACGCCUCUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-215.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -229.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 166.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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