Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0013000
Sequence Length
663 nt
GC Content
0.4917
UGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAGUGCCCCUUCCCAUCCAGAAGGUCUCAGCACACUGAUGAUAGUGCCUUGUGCAUGUCGCUGUCAGGGUUGAAUCAAGUGGGCUGUGCUGCUACCCUGCCUCAUUCUUCUGCCUUCACGCCUCUUAAGAGUGAUGACAGACCUAAUGCUCUAUUAAGUUCACCUGCAACAGAAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-196.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 158.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((.((((...(((...((((..(((((..((......(((((((((...(((((.(.((((((((((((((...((...(((((.((((((....((.(((((.....((((..(((((..(((.((.(((((((....)).))))).))......((((...((((((.((((((.............((((((......))))))...........((((....((((.......(((((((((...(((....(((.........(((((((.....))))..)))...((((......))))((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).)))))))))))))...)))))).)))....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((...............))))))))).......)))))))))))))).)))))).....))))..((((.(((((.......))))).....)))).))).))))).))))))))).))...)))))).)))))...))...)))))))).))..))))).))))).)))))))))((((((((((....)).))).))).)).......)))))))..))))...)))...))))..)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,...|,({.((((...(((.,,((((..{((({,|{{,|....(((((((((...(((((.(.((((((((((((((...((...(((((.((((((....((.(({{(.....{{{,..{{{||,,|.,.((.(((((((....)))))))).)).||,..{{{{...((((((.((((((,{{........}}|(((((......)))))}...,,....{{((((...(((((((((.(((({((,,((((..,,..{{((..,.........}|||,.....))))..|||...((((......)))),,.{|||,..,,.(((,...}}|)).))))))))))))).),,)))))),.,,.,,,}|,}|.,......(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((....,.....,....))))))))).........,,,,}})))))).)))))).....)))),,{|||.(((((.......))))).,{{{|,,,.))),.||||,|||,}}))),)),,,)))))).)))))...))...)))))))).)).,})))).))))).))))))))),.(((({{{(,....),))),})}.}}......}),)))))..}))),,.)))...)))}..)}}
Back