Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRCH3_0013200

Sequence Length

1028 nt

GC Content

0.4854

UGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAGUGCCCCUUCCCAUCCAGAAGGUCUCAGCACACUGAUGAUAGUGCCUUGUGCAUGUCGCUGUCAGGGUUGAAUCAAGUGGGCUGUGCUGCUACCCUGCCUCAUUCUUCUGCCUUCACGCCUCUUAAGAGUGAUGACAGACCUAAUGCUCUAUUAAGUUCACCUGCAACAGAAACAGUUCAUCAUUCCCCUGCAUAUUCUUUUCCUGCUGCUAUCCAGAGAAAUCAGCCUCAGCGCCCUGAAAGCUUCCUUUUCCGAGCAGGUGUCAGGGCAGAAACCAACAAAGGUCAUGCUUCACCCCUUCCUCCAUCUGCUGCACCUACCACUGAUUCUACAGAUUCCAUAACAGGACAGAAUUCAAGACAGAGAGAAGAAGAGCUGGAAUUAAUAGACCAACUGCGUAAACAUAUUGAGUACCGGUUGAAAGUGUCUCUACCUUGUGAUCUCGGAGCAGCUCUAACUGACGGUGUUGUUCUUUGCCAUUUGGCCAAUCAUGUGCGACCUCGAUCUGUCCCAAGCAUUCAUGUUCCCUCACCAGCUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-295.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -316.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 221.87

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((.((((..((((((((.....((((..(((((.(((((((((((...(((((.(.((((((((((((((...((...(((((.((((((....((.(((((.....((((..(((((..(((.((.(((((((....)).))))).))......((((...((((((.((((((.............((((((......))))))...........((((....((((.......(((((((((...(((....(((.........(((((((.....))))..)))...((((......))))((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).)))))))))))))...)))))).)))....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((...............))))))))).......)))))))))))))).)))))).....))))..((((.(((((.......))))).....)))).))).))))).))))))))).))...)))))).)))))...))...)))))))).))..))))).))))).))))))))).........((.((((.(((..((((..........((((((((.(((..(((...)))...((((((.((.((((.((((..(((((..(((((.((..(((...((((.((((.......(((((((..((((.(((....))).)))).)))))))............((((((.((...................)))).))))....))))))))...)))..))...))))).)))))....).))).).))))).))))))))))))))))).((((((.(((..((...))..)))))))))....))))..))))))).))....)).)))))))))......(((((......(((((....)).)))......)).)))))))))))..)).))...)))))))))..((.....))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((((((.((((..((((((((...,.({(,.{(((((.(((((((((((,,.(((((.(.((((((((((((((...((...(((((.((((((....((.(({{(.....{{{,..{{{||,,|.,.((.(((((((....)))))))).)).||,..{{{{...((((((.((((((,{{........}}|(((((......)))))}...,,....{{((((...(((((((((.(((({((,,((((..,,..{{((..,.........}|||,.....))))..|||...((((......)))),,.{|||,..,,.(((,...}}|)).))))))))))))).),,)))))),.,,.,,,}|,}|.,......(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((....,.....,....))))))))).........,,,,}})))))).)))))).....)))),,{|||.(((((.......))))).,{{{|,,,.))),.||||,|||,}}))),)),,,)))))).)))))...))...)))))))).)).,})))).))))).))))))))),.(((({,,(,...,},))),,}|,||.........(((((({{{(((..(((...)))...((((((.((.(((,,((({..(((((..(((((.((..(((...(({{{((((..,{,,.(((((((..((((.{{{....))),})}).))))))),{,.........{(((,,.{{..................,)))),))))....))))))))...)))..))...))))).)))))....}.))).).))))).))))))))))))))))).((((((.(((..({...})..)))))))))..,,.|||,|..,,,,}.}},,..)).))))))}}}...,..{{{{{|||...{,(((....))).}}....,.))}})}))))))))..))},)...)))))))))..{(.....,)..