Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRCH3_0013400

Sequence Length

488 nt

GC Content

0.4877

UGGAACAUGAUCUGGAUCAGAUUGACUACAUAGACAGCUGCACCGCAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGUGAGACAGCCCAAGGGACCAGACCCAGACAGCCUUAGUUCACAGUUUAUGGCGUAUAUUGAACAGCGGCGAAUCUCUCAUGAGGGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-130.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -139.34

Frequency: 0.0000

Diversity: 112.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.......((((((((...(((........((((((((.......((((..((((((((..((.((.((..((((..(((......))).....(((...(((((..((.........))..)))))...)))(((.(((((.(((.((((.((..((...))..)))))).)))))))).)))..........((((((......))))))...........)))))))).))..))).))))))))).(((.(((.......))).)))..)))))))).........(((....((((.(((.....(((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).))))))))......))).))))........)))..)))...))))))))....((((((..((((((((((...............)))))))))).....)))))).)))((((((..((...))..))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.......((((((((.{.{((........((({((((....{{{((((..((((((((..((.((.((..((((..(((......))).....,(((({((,,...(({..({{{...{,{||,,,...||.((({(((,...|}}|||)).}}.}}...))}},,))),})))))),}|||,........,.((((((......))))))...........)))))))).))..))).))))))))}}|||.,{{..,,,,.,))......}}}}}||}.....,,,.,||,...((((.(((.....(((.(((((.(((.((((.,.(((...,}),))))).))).))))))))......))),)))}........,}|..))}.|.))))))))....{(((((..((((((((((....,.....,....)))))))))).....)))))}.)))((((((..{,...,}..))).)))