Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRCH3_0013900

Sequence Length

756 nt

GC Content

0.3108

GUGUGAGCCACCGCACCCAGCCAGUAUUAUCAUUCUUUUUUUUAAAAAAAGGGCCUUGGUUUUUCCUAUCUGAAUACUUUUGAACACCGUAUUUUUUGUUGGUAAAGAGACAUACUUGUAUUUAAAGUUGGAUAAAAUUAGAUAAGUCAAAGUCCUACAGCCCAGAGAUGGCAGUGUACUAGGUGACUGAUGAAACUACUUGUUGAGGCUGCUGGAGCAAGGGGCAACUAACUAUUUUGCAAUAAAAUUAAAAAUGACACAUUAUAAUCCUUAAAGGAAUUCAUUUUCUUUUUUCCUGGUCUUUCUCUUUGAUCAUGUUAUGGUUACUUAGGCUGUAUAAAUGGAGUAUCUCUACUAAAAGUGAAAAUGCCUAUUAUACUACUAUAAAAAAAUAGUAUUUCUUUAAUUCAUUGUAUUGUUUUGUAAUAAUAUUUUUAAAAUUCUGGCUGCCUGUUACGUAUGGUAGUCUUUAUGACUUCUGUGUCAUAAAGCUUUCGUAAAAUUUAGCAUCUGUGAAAAUGUGAUGAGGCAGCAUUAUUUUAGAUGGUUUCACAACCAGUGAAGUAUCUUUUUAUUUUCCUGAACACUAUCUAAAAAUGGAAUGUUAAAAACUAACCUAUGUGAGGUGUUAAACACUCUACUAUUAUUUAAUUUUAUUAUAAUACUUGUCACAUACAUAGACCAUUCCUGUCUGAACAUGGUAUGAUUUUUUUUUUAAUUAAACCAAUGUCACAUUCAUUUUGUCAUGAAAAUUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-147.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -164.82

Frequency: 0.0000

Diversity: 248.31

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((......))))).(((((((.(((......(((((((...)))))))(((((.(((....(((((((((....(((((((.((.(((((((((........))))).))))..)).))))))))))))))...........((((...(((..((((((((....((.(((....(((....))).....))).))..))).)))))..)))(((((((........))..)))))..............))))..............(((((((......)))))))....(((((.........)))))......))..))).)))))((((((.(((.((((...((((...))))...)))))))))))))((((((......))))))...............((((((((....))))))))......))).)))))))..(((((..(((((.((.(((((((((......))))))))))).))))).....)))))((((((...((((((((((.........(((((((((((((((.....(((((((.....)))))))....)))).))))))))))).((((.((((...(((..((((.....))))))).)))).)))).((((((...........)))))))))))))))).))))))...........(((.((((((.(((((........))))).))).))))))..(((((......)))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((,,{,.,|||||(((((,(({{{{,{{,,{(((((({...,))))))}|,,{{((({{,,{{{(({(((,,(({{{,,,{,({.({{{{{{{{..,,,,..}}))}.}}}}.,)),}}})}}}},})},},},)))},,,{((((.,{{{{{{(,((({{....,))}.|}),},},,,))))))}))}.,,)})).}))).))}))),)).||{{|{||,......,,.,}}}}}...,,,,,,,,,,{(({,..,,,.........{{(((((......))}}}},....{((((........,}}}}|,,,,}}}}||},..|||}}(((({{{(((.((((.,.((((...))))...)))))))))))))((((((......))))))...............((((((((....)))))))),,{{{|.{{,|||((((((((((({,(((((.((.(((((((((......))))))))))).))))}....,|,||.,,,||{...|||||||,||}}}}}....(((((((((((((((.....(((((((.....}))))))....)))).))))))))))).,}}}}}|}}},,,.....,.,,,((({(((((...})))).}},,{,,,|.,,....,,,,}))))}}}}})))))).,,||||{.......}},||.{((((((.(((((........))))).)))},)))))}}|,,{{,,{...}}|)},,....