Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0014000
Sequence Length
618 nt
GC Content
0.3204
CCACCGCACCCAGCCAGUAUUAUCAUUCUUUUUUUUAAAAAAAGGGCCUUGGUUUUUCCUAUCUGAAUACUUUUGAACACCGUAUUUUUUGUUGGUAAAGAGACAUACUUGUAUUUAAAGUUGGAUAAAAUUAGAUAAGUCAAAGUCCUACAGCCCAGAGAUGGCAGUGUACUAGGUGACUGAUGAAACUACUUGUUGAGGCUGCUGGAGCAAGGGGCAACUAACUAUUUUGCAAUAAAAUUAAAAAUGACACAUUAUAAUCCUUAAAGGAAUUCAUUUUCUUUUUUCCUGGUCUUUCUCUUUGAUCAUGUUAUGGUUACUUAGGCUGUAUAAAUGGAGUAUCUCUACUAAAAGUGAAAAUGCCUAUUAUACUACUAUAAAAAAAUAGUAUUUCUUUAAUUCAUUGUAUUGUUUUGUAAUAAUAUUUUUAAAAUUCUGGCUGCCUGUUACGUAUGGUAGUCUUUAUGACUUCUGUGUCAUAAAGCUUUCGUAAAAUUUAGCAUCUGUGAAAAUGUGAUGAGGCAGCAUUAUUUUAGAUGGUUUCACAACCAGUGAAGUAUCUUUUUAUUUUCCUGAACACUAUCUAAAAAUGGAAUGUUAAAAACUAACCUAUGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-121.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -136.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((((.(((((((((.(((((((((...)))))))))..(((((((((((....(((((((((((....((((..........))))...)))).......))))))).....))).))))))))...(((((.(((..(((.(((.......))).))).)))...))))))))))...)))).)))).)).))).)).(((((((........))..))))).............((((((.............(((((((......)))))))....(((((.........)))))))))))))((((.((((..((((((.(((.((((...((((...))))...)))))))))))))((((((......))))))...............((((((((....))))))))((((((.(((((.((((((((((((((((((.((.(((((((((......))))))))))).))))....................))))))).)))))))....(((((((((((((((.....(((((((.....)))))))....)))).)))))))))))..))))).)))))).....)))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((.((((,{,(({{((((((((...,))))))),..,{(({{{,,||,{{{((({{(({{{,,,,.({.({{{,{{{{..,,,,..})))}.}}}}..))})))),}}},))).}}}}))))...(((((.,{{,{(((.((({{....}))).})),},}...))))))))))...)))).)))).)).))).)).(((((((,.......}}..}))))............{(((,....,,....,,,..,{{((({.....,))}}}},....(((((.........))))).,...)))((((.((((..(((({{{(((.((((.,.((((...))))...)))))))))))))((((((......))))))...............{(((((((....)))))))}((((((.(((((.((((((((((((((((((.((.(((((((((......))))))))))).)))),...,{,.,{....}}.,,.})))))).)))))))....(((((((((((((((.....(((((((.....}))))))....)))).))))))))))).,))))).)))))).....)))).))})}
Back