Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0014300
Sequence Length
622 nt
GC Content
0.4855
GGUUCACCAGUAAAGCCAGUAGCCAUUAGGGAGUUUCAAAAAACAGAAGAUAUGAGAAGAUAUUUACAUCAAAACAGGGUUCCAGCUGAGCCAUCUUCCCUCCUGUCACUAUCAGCAAGUCACAAUCAGCUGUCACACACAGACCUGGAACUUCAUCAGAGAAGGGAGCAGUUAGUAGAGCGCACUCGGAGAGAGGCUCAGCUUGCUGCCCUGCAGUAUGAGGAGGAGAAAAUAAGGACCAAGCAGAUCCAGAGAGAUGCUGUCCUGGACUUUGUCAAACAAAAAGCAUCACAAAGUCCACAAAAACAGCACCCGCUCCUAGAUGGCGUAGAUGGUGAGUGCCCCUUCCCAUCCAGAAGGUCUCAGCACACUGAUGAUAGUGCCUUGUGCAUGUCGCUGUCAGGGUUGAAUCAAGUGGGCUGUGCUGCUACCCUGCCUCAUUCUUCUGCCUUCACGCCUCUUAAGAGUGAUGACAGACCUAAUGCUCUAUUAAGUUCACCUGCAACAGAAACAGUUCAUCAUUCCCCUGCAUAUUCUUUUCCUGCUGCUAUCCAGAGAAAUCAGCCUCAGCGCCCUGAAAGCUUCCUUUUCCGAGCAGGUGUCAGGGCAGAAACCAACAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-172.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -183.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 192.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....(((((.((((....((((((.((((((.............((((((......))))))...........((((....((((.......(((((((((...(((....(((.........(((((((.....))))..)))...((((......))))((.(((((.(((.((((...(((.....))))))).))).)))))))))))))...)))))).)))....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((...............))))))))).......)))))))))))))).)))))).....((.((((....(((((.......))))).)))).))((((..((((...((((((.(((......)))))))))...)))))))))))).)))))..)))((.........(((((((((.(((((((((..((((((((((....((..(((................)))..)).....).))))))))).............(((((((........))).))))..(((.((((....))))..))).........))).)))))).)))))))))........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....(((({.((((.,,,((((((.((((((.,,......,,||((({((,,,..,||}}},..,}}....((((((..{((((({(((.(((({(({{(({{.,,,..{{((..,.......,,||||{.....))))..|||,..((((......)))){{.{|||{.{,{.((({.,.|||}}.}})}))))),))).)}})))))),,}}..,}}}}}}.,,.....(((((..((((..((....))..)))))))))(((((((((....,.....,....)))))))))........,,|.,,})))))}.)))))).,.,.((,{(((....{||||.,.,,..}}})},)}||,|,((((,.((({...((((((.(({....,,})}))))))...)))}}))))))).}))))..)))||,.,,,,.,,||||((({{.((((({,....((((((((({.{,.{{,,((,..,,,,..,,,...,,|},.,}).....}.}))))))))....|,,......,,,.,||}|||,...,.{{||,...{{{.||{{.,,,||||..|||,.,||,...))),))))}),)))))})))........})
Back