Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRCH3_0019700
Sequence Length
2356 nt
GC Content
0.4643
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-741.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -781.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 522.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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