Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRCH3_0020300

Sequence Length

471 nt

GC Content

0.4607

CAUAUUGAGUACCGGUUGAAAGUGUCUCUACCUUGUGAUCUCGGAGCAGCUCUAACUGACGGUGUUGUUCUUUGCCAUUUGGCCAAUCAUGUGCGACCUCGAUCUGUCCCAAGCAUUCAUGUUCCCUCACCAGCUGUACCUAAAUUAACAAUGGCGAAAUGCAGGCGAAAUGUGGAAAAUUUCCUAGAAGCUUGCAGAAAAAUUGGUGUACCUCAGGACAAUCUUUGUUCCCCUUCCGACAUCCUUCAGCUAAACCUCAGCGUUAAAAGAACUGUUGAAACGCUCCUUUCUCUUGGGGCACACUCAGAAGAAUCCAGUUUUGUCUGUCUCUCUCUGCAGCUUCUGGGUUUUGUGGCAUUUUACUGUACUGUGAUGUUAACUCUCUGUGUGCUUUAUUACUGGCUCUUCCCCGCUCGCUGAAAGAUUGCACUCCGGUGACUUUCUGCCUCAUUCCUGUGCUUGGUAAAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-111.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -121.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 121.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..((((...(((.((((((.....((((.((((((((.(((((((((...((.(((((.(((((.(...(((....))).......).))))).))).)).))....))).....)))))).....((((.(((((....((((((.(.(((...(((((..(((((((.(.(((...((((((((((.(((((......(((((.((((((((.......((((........)))).................((((((..((......))..))))))......)))))))).)))))((((.(((......))).))))......))))))))))))))).))).).))))))).))))).))).)))))))......).)))).........(((........))).))))..))))))))....)))))))))).)))..)))).))))(((.......)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.((({,.,(((((.,{(.{,..,.}},,,{{{{,...(((((((((...,{.(((((.(((({.|,{,(((....))).,,..,.}.))))}.})).)).))....})).....))))}}.}}}}})))))},,.....{(((({,(.(((...(((((..(((((((.{.{({...((((((((({{(((((......(((((.,,,,{((({{,....}|||,.......}))),}.....,.......{{((((((.....,,,.))))},..|{{{{.......,))))}|||,.(((({{{,....,,))).,})),.....))))))))))))))).})).).))))))).))))).))).)))))))..}}}.)))))((((.(((({(((.{..........((.(((((.{{{({{....)))}))))).)).........).))},})))).))))