Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0000400
Sequence Length
692 nt
GC Content
0.4436
ACGUGUGCCACCACUAUUGUGUGAAUUCUGAAUCAUGUACCAUUGGGGAUGAUGGAAGUGUUGAAUGUGUCUGUCCAACGCGCUAUGAAGGACCAAAAUGUGAGGUUGACAAGUGUGUAAGGUGCCAUGGGGGGCACUGCAUUAUAAAUAAAGACAGUGAAGAUAUAUUUUGCAACUGCACUAAUGGAAAGAUUGCCUCUAGCUGUCAGUUAUGUGAUGGCUACUGUUACAAUGGUGGCACAUGCCAGCUGGACCCCGAGACAAAUGUACCUGUGUGUCUAUGCUCCACCAACUGGUCAGGCACACAGUGUGAAAGGCCAGCCCCAAAGAGCAGCAAGUCUGAUCAUAUCAGCACAAGAAGCAUUGCCAUCAUUGUGCCUCUCGUCCUCUUGGUGACUUUGAUAACCACCUUAGUAAUUGGUUUAGUGCUUUGUAAAAGAAAAAGAAGGACAAAAACAAUUAGAAGACAACCUAUUAUCAAUGGAGGAAUAAAUGUAGAAAUUGGCAAUCCAUCUUAUAACAUGUAUGAGGUAGAUCAUGAUCACAACGAUGGAGGUCUUUUAGAUCCUGGCUUUAUGAUAGACCCAACAAAGGCCAGGUACAUAGGGGGAGGACCCAGUGCUUUCAAGCUUCCACACACAGCGCCGCCCAUCUACCUAAACUCUGAUUUGAAAGGACCACUAACUGCUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-183.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -195.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.((((.........((((((.(((((.(((........))).)))))..(((((((.(((((.(((.((((((..(.(.(((((.....(((....(((.(((((..((((((((..((((((......))))))........................))))))))..))))).)))...)))...(((((((..(((((((((......)))))))))....(((((((((((((.((((..(((((.((............(((((((((((((.....(((.....)))..)))))))))).)))...)))))))...............(((((((...))))).)).....))))))))))))))))).......((((((((((..........)))).(((..((((((..((.((.((((............)))).)).))..)))))).)))................))))))...............))))))).((((((((.....))))))))(((((.(.(((.....))).).))))).......(((((((((.((.......))...)))))))))..))))).))..))))..))))).))))))))))))))))))))))))((((.(.........(((.........))).........).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((.((((,,.,.....((((((.,{{{{.,(({{,...,,}}},)),))},|((((((.(((((.(((.((((((..(.(.(((((.....(({....(((.{((((.{((((((((..((((((......)))))).,.,,............,,,,...)))))))),}))))).)))...)))...(((((((..(((((((((......)))))))))..,.{((((((((((((.((((..(((((.((.....,,.....{{{((((((((((..,..(((.....))).,)))))))))).))}...)))))))...............(((((((...})))).}}.....))))))))))))))))}{...,..((((((,((({,...,{,,,,.,,.{{{..((((((.,((.((.((((............)))).)).)),.)))))).}}}........}}}}}}..)))))).....,,.,.,...,))))))).((((((((.....))))))))(((((.(.(((.....))).).))))).......(((((((((.((.......,,.,,)))))))))..))))),}},.)))}.,})})).))))}))))))})}}}})))))))((((.|.........{{{........,))}.........).))))
Back