Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0000600
Sequence Length
1337 nt
GC Content
0.4203
GUUUGGCUGUGGAUUAUUUUAGUGAACGCAUAUAUUGGGCUGACUUUGAGCUCUCCAUCAUUGGCAGUGUUCUGUAUGAUGGCUCUAAUUCAGUAGUCUCUGUCAGCAGCAAACAAGGUUUAUUACAUCCACAUAGGAUCGAUAUCUUUGAAGAUUAUAUAUAUGGAGCAGGACCUAAAAAUGGUGUAUUUCGAGUUCAAAAAUUUGGCCAUGGUUCAGUAGAGUACUUAGCUUUAAAUAUUGAUAAAACAAAAGGUGUUUUGAUAUCUCAUCGUUAUAAACAACUAGAUUUACCCAAUCCAUGCUUGGAUUUAGCAUGCGAAUUUCUUUGCUUGCUAAAUCCUUCUGGGGCCACUUGUGUGUGUCCAGAAGGAAAAUAUUUGAUUAAUGGCACCUGCAAUGAUGACAGCCUGUUAGAUGAUUCAUGUAAGUUAACUUGUGAAAAUGGAGGAAGAUGCAUUUUAAAUGAGAAAGGUGAUUUGAGGUGUCACUGUUGGCCCAGUUAUUCAGGAGAAAGAUGUGAAGUCAACCACUGUAGCAACUACUGCCAGAAUGGAGGAACUUGCGUACCAUCAGUUCUAGGGAGACCCACCUGCAGCUGUGCACUGGGUUUCACUGGGCCAAACUGUGGUAAGACAGUCUGUGAGGAUUUUUGUCAAAAUGGAGGAACCUGCAUUGUGACUGCUGGAAACCAGCCUUACUGCCACUGCCAGCCGGAAUACACCGGAGACAGAUGUCAGUACUACGUGUGCCACCACUAUUGUGUGAAUUCUGAAUCAUGUACCAUUGGGGAUGAUGGAAGUGUUGAAUGUGUCUGUCCAACGCGCUAUGAAGGACCAAAAUGUGAGGUUGACAAGUGUGUAAGGUGCCAUGGGGGGCACUGCAUUAUAAAUAAAGACAGUGAAGAUAUAUUUUGCAACUGCACUAAUGGAAAGAUUGCCUCUAGCUGUCAGUUAUGUGAUGGCUACUGUUACAAUGGUGGCACAUGCCAGCUGGACCCCGAGACAAAUGUACCUGUGUGUCUAUGCUCCACCAACUGGUCAGGCACACAGUGUGAAAGGCCAGCCCCAAAGAGCAGCAAGUCUGAUCAUAUCAGCACAAGAAGCAUUGCCAUCAUUGUGCCUCUCGUCCUCUUGGUGACUUUGAUAACCACCUUAGUAAUUGGUUUAGUGCUUUGUAAAAGAAAAAGAAGGACAAAAACAAUUAGAAGACAACCUAUUAUCAAUGGAGGAAUAAAUGUAGAAAUUGGCAAUCCAUCUUAUAACAUGUAUGAGGUAGAUCAUGAUCACAACGAUGGAGGUCUUUUAGAUCCUGGCUUUAUGAUAGACCCAACAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-379.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -403.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 250.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((.....((((((((.......(((.((((((...((((((((((((((..((((....))))))))))).........)).)).))).))))))..))).....)))))))).))))))...)).)))).))(((((.......(((.((((((((((((.((((((..(((((((((((.((.........((((..((((((((((((((.....))))....)))))).((((((.....))))))(((((((((..(((((.........(((((((...(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((..(((....)))..))))))))))........(((((.(((((.(((((....)).)))..)))))..)))))...)))))))..(((((.((((((.(......).))))))..)))))....))))).)))))))))....((((((((((..(((....)))....(((........))).((((...))))..(((((((.((((.((....)).)).)).))))).))((((((((..((((....)))).))))))))))))))))))(((((......)))))..((((((......((((.((((.((....)).)))).))))..((((...)))))))))).))))..)))))))))))))))))...(((....))).((((.....)))).(((.(((((((((((........(((((..(((((((......((.(..(((.(((((((((((((..(((((((.((...((((.........))))..)))))))))..((((((......))))))..............))).....)))))))))).)))..).)))))))))...(((((((..(((((((((......)))))))))....(((((((((((((.((((..(((((.((............(((((((((((((.....(((.....)))..)))))))))).)))...)))))))...............(((((((...))))).)).....))))))))))))))))).......((((((((((..........)))).(((..((((((..((.((.((((............)))).)).))..)))))).)))................))))))...............))))))).((((((((.....))))))))....))))))))).))))))).))).)))))).)))).))))))))))).......)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((.....((((((((.......{((.((((((...((((((((((((((..((((....))))))))))).........)).)).))).))))))..))}.....)))))))).))))))}..,).)))).))(((((.......(((.((((((((((((.((((((.,(((((((((((.((.........((((..(((({(((((((((.....)))),...}})))}.{(((((.....)))))}|{{((((({,,(((,,..{{{{...{{{((((..,(((((....)))))|(((((.(((((....})))).)))))}.((((((((((,,(((....))).,))))))))))....,..{{({{{.(((((.(((({....}).)))..})))).,}}},}}}.)))}}}}..{||||.{{{{||.{......),||||||,,||,|,....})}))})))))))))|,..((((((((((..,{(....|,..{,{(({.,{{,...|}}|({{(,..}},),,|{{{{{|||,((.((,...)).)).)).})))).)}((((((((..((((....)))).)))))))))))))))))){{{{{,.....})))|,,{{{{||,.....((((.((((.((....)).)))).)))).(((((...)))))))))).))))..)))))))))))))))))}..(((....))).((((.....)))).(((.(((((((((((.,{,((,{((,.,,,((({{(({{{{{{,({.{{(((.(((((((((({{(..(((((((.((...((((.........))))..)))))))))..((((((......))))))..............},}},.,.}))))))))).))},}).},}}}}}}}...{{{|||{..(((((((((......)))))))))..,.(((((((((((((.((((..(((((.((.....,,.....{{{((((((((((..,..(((.....))).,)))))))))).))}...)))))))...............(((((((...))))).)).....)))))))))))))))))}},.}}}|||||,}||||,,..||||,.....{{{..((((((.,((.((.((((............)))).)).))..)))))).})}......,.}}}}}},,))}}},....,{,.....,,,}))}})),((((((((.....)))))))).}}))).)))))),,)))))).))).)))))).)))),})))))))))).......)))))
Back