Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0000700

Sequence Length

1192 nt

GC Content

0.4287

GUUUGGCUGUGGAUUAUUUUAGUGAACGCAUAUAUUGGGCUGACUUUGAGCUCUCCAUCAUUGGCAGUGUUCUGUAUGAUGGCUCUAAUUCAGUAGUCUCUGUCAGCAGCAAACAAGGUUUAUUACAUCCACAUAGGAUCGAUAUCUUUGAAGAUUAUAUAUAUGGAGCAGGACCUAAAAAUGGUGUAUUUCGAGUUCAAAAAUUUGGCCAUGGUUCAGUAGAGUACUUAGCUUUAAAUAUUGAUAAAACAAAAGGUGUUUUGAUAUCUCAUCGUUAUAAACAACUAGAUUUACCCAAUCCAUGCUUGGAUUUAGCAUGCGAAUUUCUUUGCUUGCUAAAUCCUUCUGGGGCCACUUGUGUGUGUCCAGAAGGAAAAUAUUUGAUUAAUGGCACCUGCAAUGAUGACAGCCUGUUAGAUGAUUCAUGUAAGUUAACUUGUGAAAAUGGAGGAAGAUGCAUUUUAAAUGAGAAAGGUGAUUUGAGGUGUCACUGUUGGCCCAGUUAUUCAGGAGAAAGAUGUGAAGUCAACCACUGUAGCAACUACUGCCAGAAUGGAGGAACUUGCGUACCAUCAGUUCUAGGGAGACCCACCUGCAGCUGUGCACUGGGUUUCACUGGGCCAAACUGUGGUAAGACAGUCUGUGAGGAUUUUUGUCAAAAUGGAGGAACCUGCAUUGUGACUGCUGGAAACCAGCCUUACUGCCACUGCCAGCCGGAAUACACCGGAGACAGAUGUCAGUACUACGUGUGCCACCACUAUUGUGUGAAUUCUGAAUCAUGUACCAUUGGGGAUGAUGGAAGUGUUGAAUGUGUCUGUCCAACGCGCUAUGAAGGACCAAAAUGUGAGGUUGACAAGUGUGUAAGGUGCCAUGGGGGGCACUGCAUUAUAAAUAAAGACAGUGAAGAUAUAUUUUGCAACUGCACUAAUGGAAAGAUUGCCUCUAGCUGUCAGUUAUGUGAUGGCUACUGUUACAAUGGUGGCACAUGCCAGCUGGACCCCGAGACAAAUGUACCUGUGUGUCUAUGCUCCACCAACUGGUCAGGCACACAGUGUGAAAGGCCAGCCCCAAAGAGCAGCAAGUCUGAUCAUAUCAGCACAAGAAGCAUUGCCAUCAUUGUGCCUCUCGUCCUCUUGGUGACUUUGAUAACCACCUUAGUAAUUGGUUUAGUGCUUUGUAAAAGAAAAAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-341.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -363.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 295.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((...(((((((.....((((((((.......(((.((((((...((((((((((((((..((((....))))))))))).........)).)).))).))))))..))).....)))))))).)))))))..))))(.(((((((((.......(((.(((((.(((((((........(((((((((((.((.........((((..((((((((((((((.....))))....)))))).((((((.....))))))(((((((((..(((((.........(((((((...(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((..(((....)))..))))))))))........(((((.(((((.(((((....)).)))..)))))..)))))...)))))))..(((((.((((((.(......).))))))..)))))....))))).)))))))))....((((((((((..(((....)))....(((........))).((((...))))..(((((((.((((.((....)).)).)).))))).))((((((((..((((....)))).))))))))))))))))))(((((......)))))..((((((......((((.((((.((....)).)))).))))..((((...)))))))))).))))..)))))))))))))))))..(((((.((.((((((((.(((...((.(((....(((((((........)))))))....)))))...)))..)))))))))).))))))))).(((((((.((...((((.........))))..)))))))))...(((((......)))))))).))))).))).......))))))))).((((((((..(((((((......((((((...(((((((((......)))))))))....(((((((((((((.((((..(((((.((............(((((((((((((.....(((.....)))..)))))))))).)))...)))))))...............(((((((...))))).)).....)))))))))))))))))..............((((...........))))...))))))...))))))).)))))))).........)

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{{{(((((,({..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((({((,...}}),...(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).{.(((.......))).}.....)))))))))...)))))))))))))).))))))),,}}))}.,|,,|.,,,,{{{{{((.....}}))))}{||||{.,,.{{{....,,,,,..|,,...({{,(((((....))))){(((((.(((((....))))).)))))}.((((((((((,,(((....))).,)))))))))).............{(((((((((((....{{.((((((,,{(.((((((({.,,,,,....((({{.{{{{((.{......},||||||,,||}|}...{{|{||,,,}}}})))}}}.((((((((((..,{{....|,..{,{(({.,{{,..,||||({{(,..}},),,|{{|{{|||,((.{(,...)).}).)).})))).}}((((((((..((((....)))).))))))))))))))))))||,(({{{{.,||||{({,,..|}}},...((((.((((.((....)).)))).)))).(((((...))))),,|||{{}|||,|,,,.((((......)))).|,|}}.})})}|||{...,,})}}|||(((....}}))).....}))))))).}}{{{{{(({,.{.({((..(((({(,{{,.,,,,}}.)}}}||,||}}.....,||,....,..}))))}.)).,,.))),,))))))}},}}}},((((({.{{,....,,}.}.))))).,,},,,.|{{{((((..((((({,.,,...{,{|||,..(((((((((......)))))))))..|.(((((((((((((.((((..(((((.((.....,,.....{{{((((((((((..,..(((.....))).,)))))))))).))}...)))))))...............(((((((...))))).)).....))))))))))))))))),,..,||,||,,.,||||,........,,}|}}...,,,,,}}})))))))).))))))},..........