Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0002000
Sequence Length
1024 nt
GC Content
0.4248
GUUUGGCUGUGGAUUAUUUUAGUGAACGCAUAUAUUGGGCUGACUUUGAGCUCUCCAUCAUUGGCAGUGUUCUGUAUGAUGGCUCUAAUUCAGUAGUCUCUGUCAGCAGCAAACAAGGUUUAUUACAUCCACAUAGGAUCGAUAUCUUUGAAGAUUAUAUAUAUGGAGCAGGACCUAAAAAUGGUGUAUUUCGAGUUCAAAAAUUUGGCCAUGGUUCAGUAGAGUACUUAGCUUUAAAUAUUGAUAAAACAAAAGGUGUUUUGAUAUCUCAUCGUUAUAAACAACUAGAUUUACCCAAUCCAUGCUUGGAUUUAGCAUGCGAAUUUCUUUGCUUGCUAAAUCCUUCUGGGGCCACUUGUGUGUGUCCAGAAGGAAAAUAUUUGAUUAAUGGCACCUGCAAUGAUGACAGCCUGUUAGAUGAUUCAUGUAAGUUAACUUGUGAAAAUGGAGGAAGAUGCAUUUUAAAUGAGAAAGGUGAUUUGAGGUGUCACUGUUGGCCCAGUUAUUCAGGAGAAAGAUGUGAAGUCAACCACUGUAGCAACUACUGCCAGAAUGGAGGAACUUGCGUACCAUCAGUUCUAGGGAGACCCACCUGCAGCUGUGCACUGGGUUUCACUGGGCCAAACUGUGGUAAGACAGUCUGUGAGGAUUUUUGUCAAAAUGGAGGAACCUGCAUUGUGACUGCUGGAAACCAGCCUUACUGCCACUGCCAGCCGGAAUACACCGGAGACAGAUGUCAGUACUACGUGUGCCACCACUAUUGUGUGAAUUCUGAAUCAUGUACCAUUGGGGAUGAUGGAAGUGUUGAAUGUGUCUGUCCAACGCGCUAUGAAGGACCAAAAUGUGAGGUUGACAAGUGUGUAAGGUGCCAUGGGGGGCACUGCAUUAUAAAUAAAGACAGUGAAGAUAUAUUUUGCAACUGCACUAAUGGAAAGAUUGCCUCUAGCUGUCAGUUAUGUGAUGGCUACUGUUACAAUGGUGGCACAUGCCAGCUGGACCCCGAGACAAAUGUACCUGUGUGUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-298.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -316.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 193.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((.((((..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((((((....)))....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).(.(((.......))).).....)))))))))...)))))))))))))).)))))))...................((((((.....))))))(((((((((..(((((.........(((((((...(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((..(((....)))..))))))))))........(((((.(((((.(((((....)).)))..)))))..)))))...)))))))..(((((.((((((.(......).))))))..)))))....))))).)))))))))....((((((((((..(((....)))....(((........))).((((...))))..(((((((.((((.((....)).)).)).))))).))((((((((..((((....)))).))))))))))))))))))(((((......)))))..((((((......((((.((((.((....)).)))).))))..((((...))))))))))..)))).))))).)(((.(((((.((..(((..((((.......((((((((((((...((((((((........))))...(((((((......((.(..(((.(((((((((((((..(((((((.((...((((.........))))..)))))))))..((((((......))))))..............))).....)))))))))).)))..).)))))))))............(((((((((......))))))))).....))))))))))))))))((....)).......))))..))).)).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((.((((..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((({((....}})....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).{.(((.......))).}.....)))))))))...)))))))))))))).))))))).......,{{,,{,{{,.,{{{{({.....}})))}|{||{{{{,,,{({....,,,,...|{{,{{,..,(((((....)))))|(((((.(((((....})))).)))))}.((((((((((,,(((....))).,)))))))))).,,}||,|||,,,.(((((,(({((....|}.|}|,,|}}||.,||,.,}},}))}}}}..{||||.{{{{{{.{......),)}}|||,,||}|}...,}),))})))))))))}...((((((((((..,{(....|,..{,{(({.,{{,...|}}|({{(,..}},),,|{{{{{|||,((.((,...)).)).)).})))).)}((((((((..((((....)))).)))))))))))))))))){((((......))))},.(((((|......((((.((((.((....)).)))).)))).{((((...))))))))))..)))).))))).)(({,(((((.((..(((..((((,,,....((((((((((({,,{((((((,...,,,..{{{{{...((,,,||,.}}))}}},|{(((.((((((((((,{(..(((((((.((...((((.........))))..)))))))))..((((((......))))))..............},},,.,.}))))))))).))},}}})}),)))))....,,,,.{..(((((((((......)))))))))..}..,))})))))))))))),,.,,}||...,,..))))..))).)).))))))))
Back