Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0002100
Sequence Length
1355 nt
GC Content
0.4303
UGUCCUGAAUUUAAAAGGCCCAGGGACAUUGCAGUUGACUGGGUGGCUGGAAACAUUUACUGGACUGAUCAUUCUAGAAUGCAUUGGUUCAGUUACUACACUACUCACUGGACCAGUCUGAGGUACUCUAUCAACGUAGGGCAGCUGAAUGGCCCCAACUGCACCAGACUCUUAACAAAUAUGGCUGGAGAACCCUAUGCUAUUGCAGUAAAUCCUAAAAGAGGGAUGAUGUACUGGACUGUUGUUGGGGAUCAUUCCCAUAUAGAAGAAGCAGCCAUGGAUGGUACACUGAGAAGGAUUUUAGUACAAAAGAACUUACAGAGACCCACAGGUUUGGCUGUGGAUUAUUUUAGUGAACGCAUAUAUUGGGCUGACUUUGAGCUCUCCAUCAUUGGCAGUGUUCUGUAUGAUGGCUCUAAUUCAGUAGUCUCUGUCAGCAGCAAACAAGGUUUAUUACAUCCACAUAGGAUCGAUAUCUUUGAAGAUUAUAUAUAUGGAGCAGGACCUAAAAAUGGUGUAUUUCGAGUUCAAAAAUUUGGCCAUGGUUCAGUAGAGUACUUAGCUUUAAAUAUUGAUAAAACAAAAGGUGUUUUGAUAUCUCAUCGUUAUAAACAACUAGAUUUACCCAAUCCAUGCUUGGAUUUAGCAUGCGAAUUUCUUUGCUUGCUAAAUCCUUCUGGGGCCACUUGUGUGUGUCCAGAAGGAAAAUAUUUGAUUAAUGGCACCUGCAAUGAUGACAGCCUGUUAGAUGAUUCAUGUAAGUUAACUUGUGAAAAUGGAGGAAGAUGCAUUUUAAAUGAGAAAGGUGAUUUGAGGUGUCACUGUUGGCCCAGUUAUUCAGGAGAAAGAUGUGAAGUCAACCACUGUAGCAACUACUGCCAGAAUGGAGGAACUUGCGUACCAUCAGUUCUAGGGAGACCCACCUGCAGCUGUGCACUGGGUUUCACUGGGCCAAACUGUGGUAAGACAGUCUGUGAGGAUUUUUGUCAAAAUGGAGGAACCUGCAUUGUGACUGCUGGAAACCAGCCUUACUGCCACUGCCAGCCGGAAUACACCGGAGACAGAUGUCAGUACUACGUGUGCCACCACUAUUGUGUGAAUUCUGAAUCAUGUACCAUUGGGGAUGAUGGAAGUGUUGAAUGUGUCUGUCCAACGCGCUAUGAAGGACCAAAAUGUGAGGUUGACAAGUGUGUAAGGUGCCAUGGGGGGCACUGCAUUAUAAAUAAAGACAGUGAAGAUAUAUUUUGCAACUGCACUAAUGGAAAGAUUGCCUCUAGCUGUCAGUUAUGUGAUGGCUACUGUUACAAUGGUGGCACAUGCCAGCUGGACCCCGAGACAAAUGUACCUGUGUGUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-405.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -428.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 278.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(((((((((.(((((...(((..(.((((((((((...((((((.(((.(((....(((((..(((.(((((((((((.............)))))))))))...((.(.((((((....)))))).).))(((((((((((((.(((((((.............((((((((......))).)))))((((....(((((......)))))..))))))))..))).))))))).)))))).))).)))))....))))))))))))....(((((((....)))))))..(((((..(((((((....((((((......))))))..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((((((....)))....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).(.(((.......))).).....)))))))))...)))))))))))))).)))))))...................((((((.....))))))(((((((((..(((((.........(((((((...(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((..(((....)))..))))))))))........(((((.(((((.(((((....)).)))..)))))..)))))...)))))))..(((((.((((((.(......).))))))..)))))....))))).)))))))))....((((((((((..(((....)))....(((........))).((((...))))..(((((((.((((.((....)).)).)).))))).))((((((((..((((....)))).))))))))))))))))))(((((......))))))))))))..)))))((((.((((.((....)).)))).)))).(((((...)))))..(((((.(((((....((((......))))...))).)).)))))...((((((((((((...((((((((........))))...(((((((......((.(..(((.(((((((((((((..(((((((.((...((((.........))))..)))))))))..((((((......))))))..............))).....)))))))))).)))..).)))))))))............(((((((((......))))))))).....))))))))))))))))))))))..)))).).))).))))).)))).).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.............)(((((((((.{((((...(((..{.((((((((((...{{{{{(,(((,(((,,,,(({{{..|||.|||{{{{{{{{.............|}})}}))}}|..,((,(.((((((....}))))).|,}}(((((((((((((.(((((((,{,,....,....((((({((......)}}.))))),{{{....(((((......)))))..,)),))))..))).))))))).)))))).}}}.}}}}}....)})))})))))){{,,({((({,....}}}))))||(((((..(((((((,...((((((......))))))..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((({((....}})....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).{.(((.......))).}.....)))))))))...)))))))))))))).))))))).......{{{{{{{{{,.,{{{{({.....}})))||{|{{{{{,..(({....,,,,...|{{,,,,..,(((((....)))))|(((((.(((((....})))).)))))}.((((((((((,,(((....))).,)))))))))).,,}|}}|||,,,.(((((,((,((....|}.|}|,,|}}||.,||,.,}},})}},}}..{||||.{{{(((.{......).)))))}..}}}}}...,}),))})))))))))}...((((((((((..,{(....|,..{,{(({.,{{,...|}}|({{(,..}},),,|{{{{{|||,((.((,...)).)).)).})))).)}((((((((..((((....)))).)))))))))))))))))){((((......))))))))))))..)))))((((.((((.((....)).)))).)))).(((((...)))))..(((((.(((((....((((......)))).,.))).)).)))))...((((((((((({{,,{{{{({|,.,|||..,||||.,.((||||}}.}))))}},,,(((.((((((((((,{(..(((((((.((...((((.........))))..)))))))))..((((((......))))))..............},},,.,.}))))))))).))}.))})})})}}})..,,|.||,|..{((((((((......))))))))}..|..,}}}))))))))))))))))))..)))).).))).))))}.)))).).))))
Back