Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0002200

Sequence Length

2108 nt

GC Content

0.3942

AACAAAAUUAUGUGUGGUGAGGAUGCAGAGCAUCUGAGUUUUUCUCACAUUGCUGAAAAGAUCGUAAAUUGCUACAAACUCUUUGAAAAUUUUUUCUAGCAGCAUCCUAUCAAGCUAAGUGUGCAUAAACUUGAAGACACUAAUUCUAUUCCUUGGUAAAUACCCAAAGAAAUUGAGUGUUUGUAUCCAUCAAAAAAAAAAAAAGUACUAAACUAUCCAUAACUUUAGUUGUAAUGGCCUAAGACUGUAACCAAGCCAAGUGGAUAUUGUCAGAACAGUAAACAAAUACUACUGAGCAAUGAAAAGAUUAAAAAUUGAUAUAUACAAAAUAAGGAUACAUUUCAUAGUCAUGAUGUUGAACAAAAGAUUUCUGGAAUGAAAGACUAUGAUUCUUUGUUACAUUUUACGCCACUAAUCUGUGGUGUUAGAUAUCAGAAUUAUGGUUACUCUAAGGAAAAUAUUGACUGCAGGAAGUCACGGGUGAACCUCCUAUGGUUCUGGAAAUAUUUCAGCAGAGUAAUGGUUAAACAGGUGCAAUCUGGUUAAACUCCAGUGAUCUGUACAAUUAAGAUUCAUGCAGAUAAUACAUCUGCAAAGAUUGAAAAUAGCAUUAAAUAUCUUUUUGACAUCUAUAUAGCAAUUAACUCAUGACUAUGUUCUUACAAUUCCCCCAUAACUUCAAUGUAAAGAUACAGAAAACUCCGCUAAUUUCCUGUUGAAAAUACCGUGGUGUGUUGUUUUGUUUCCUUGUAGUGUCCUGAAUUUAAAAGGCCCAGGGACAUUGCAGUUGACUGGGUGGCUGGAAACAUUUACUGGACUGAUCAUUCUAGAAUGCAUUGGUUCAGUUACUACACUACUCACUGGACCAGUCUGAGGUACUCUAUCAACGUAGGGCAGCUGAAUGGCCCCAACUGCACCAGACUCUUAACAAAUAUGGCUGGAGAACCCUAUGCUAUUGCAGUAAAUCCUAAAAGAGGGAUGAUGUACUGGACUGUUGUUGGGGAUCAUUCCCAUAUAGAAGAAGCAGCCAUGGAUGGUACACUGAGAAGGAUUUUAGUACAAAAGAACUUACAGAGACCCACAGGUUUGGCUGUGGAUUAUUUUAGUGAACGCAUAUAUUGGGCUGACUUUGAGCUCUCCAUCAUUGGCAGUGUUCUGUAUGAUGGCUCUAAUUCAGUAGUCUCUGUCAGCAGCAAACAAGGUUUAUUACAUCCACAUAGGAUCGAUAUCUUUGAAGAUUAUAUAUAUGGAGCAGGACCUAAAAAUGGUGUAUUUCGAGUUCAAAAAUUUGGCCAUGGUUCAGUAGAGUACUUAGCUUUAAAUAUUGAUAAAACAAAAGGUGUUUUGAUAUCUCAUCGUUAUAAACAACUAGAUUUACCCAAUCCAUGCUUGGAUUUAGCAUGCGAAUUUCUUUGCUUGCUAAAUCCUUCUGGGGCCACUUGUGUGUGUCCAGAAGGAAAAUAUUUGAUUAAUGGCACCUGCAAUGAUGACAGCCUGUUAGAUGAUUCAUGUAAGUUAACUUGUGAAAAUGGAGGAAGAUGCAUUUUAAAUGAGAAAGGUGAUUUGAGGUGUCACUGUUGGCCCAGUUAUUCAGGAGAAAGAUGUGAAGUCAACCACUGUAGCAACUACUGCCAGAAUGGAGGAACUUGCGUACCAUCAGUUCUAGGGAGACCCACCUGCAGCUGUGCACUGGGUUUCACUGGGCCAAACUGUGGUAAGACAGUCUGUGAGGAUUUUUGUCAAAAUGGAGGAACCUGCAUUGUGACUGCUGGAAACCAGCCUUACUGCCACUGCCAGCCGGAAUACACCGGAGACAGAUGUCAGUACUACGUGUGCCACCACUAUUGUGUGAAUUCUGAAUCAUGUACCAUUGGGGAUGAUGGAAGUGUUGAAUGUGUCUGUCCAACGCGCUAUGAAGGACCAAAAUGUGAGGUUGACAAGUGUGUAAGGUGCCAUGGGGGGCACUGCAUUAUAAAUAAAGACAGUGAAGAUAUAUUUUGCAACUGCACUAAUGGAAAGAUUGCCUCUAGCUGUCAGUUAUGUGAUGGCUACUGUUACAAUGGUGGCACAUGCCAGCUGGACCCCGAGACAAAUGUACCUGUGUGUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-572.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -611.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 395.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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