Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0002400

Sequence Length

442 nt

GC Content

0.4774

GGAGACCCACCUGCAGCUGUGCACUGGGUUUCACUGGGCCAAACUGUGGUAAGACAGUCUGUGAGGAUUUUUGUCAAAAUGGAGGAACCUGCAUUGUGACUGCUGGAAACCAGCCUUACUGCCACUGCCAGCCGGAAUACACCGGAGACAGAUGUCAGUACUACGUGUGCCACCACUAUUGUGUGAAUUCUGAAUCAUGUACCAUUGGGGAUGAUGGAAGUGUUGAAUGUGUCUGUCCAACGCGCUAUGAAGGACCAAAAUGUGAGGUUGACAAGUGUGUAAGGUGCCAUGGGGGGCACUGCAUUAUAAAUAAAGACAGUGAAGAUAUAUUUUGCAACUGCACUAAUGGAAAGAUUGCCUCUAGCUGUCAGUUAUGUGAUGGCUACUGUUACAAUGGUGGCACAUGCCAGCUGGACCCCGAGACAAAUGUACCUGUGUGUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-129.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -139.14

Frequency: 0.0000

Diversity: 95.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((..((((....)))).))))))))...((((((.(((((......)))))..............((((.((((.((....)).)))).)))).(((((...)))))..(((((.(((((....((((......))))...))).)).)))))...((((((((((((...((((((((........))))...(((((((......((.(..(((.(((((((((((((..(((((((.((...((((.........))))..)))))))))..((((((......))))))..............))).....)))))))))).)))..).)))))))))............(((((((((......))))))))).....)))))))))))))))).....))).)))..(((((.((......)).)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((((((((..((((....)))).)))))))).{,((((((.,{{({{,,...}}|||({....}},,....((((.((((.((....)).)))).)))).(((((...)))))..(((((.(((((....((((......))))...))).)).)))))...((((((((((({,,{((((((,...,,,..{{{{{...((,,,||,.}}))}}},|{(((.((((((((((,{(..(((((((.((...((((.........))))..)))))))))..((((((......))))))..............},},,.,.}))))))))).))},}}})}),)))))....,,,,.{..(((((((((......)))))))))..}..,))}))))))))))))|},,.})).})),,{|||{.,|,,....)),)))))