Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0002700
Sequence Length
744 nt
GC Content
0.4153
GUUUGGCUGUGGAUUAUUUUAGUGAACGCAUAUAUUGGGCUGACUUUGAGCUCUCCAUCAUUGGCAGUGUUCUGUAUGAUGGCUCUAAUUCAGUAGUCUCUGUCAGCAGCAAACAAGGUUUAUUACAUCCACAUAGGAUCGAUAUCUUUGAAGAUUAUAUAUAUGGAGCAGGACCUAAAAAUGGUGUAUUUCGAGUUCAAAAAUUUGGCCAUGGUUCAGUAGAGUACUUAGCUUUAAAUAUUGAUAAAACAAAAGGUGUUUUGAUAUCUCAUCGUUAUAAACAACUAGAUUUACCCAAUCCAUGCUUGGAUUUAGCAUGCGAAUUUCUUUGCUUGCUAAAUCCUUCUGGGGCCACUUGUGUGUGUCCAGAAGGAAAAUAUUUGAUUAAUGGCACCUGCAAUGAUGACAGCCUGUUAGAUGAUUCAUGUAAGUUAACUUGUGAAAAUGGAGGAAGAUGCAUUUUAAAUGAGAAAGGUGAUUUGAGGUGUCACUGUUGGCCCAGUUAUUCAGGAGAAAGAUGUGAAGUCAACCACUGUAGCAACUACUGCCAGAAUGGAGGAACUUGCGUACCAUCAGUUCUAGGGAGACCCACCUGCAGCUGUGCACUGGGUUUCACUGGGCCAAACUGUGGUAAGACAGUCUGUGAGGAUUUUUGUCAAAAUGGAGGAACCUGCAUUGUGACUGCUGGAAACCAGCCUUACUGCCACUGCCAGCCGGAAUACACCGGAGACAGAUGUCAGUACU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-213.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -225.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 150.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((((((....)))....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).(.(((.......))).).....)))))))))...)))))))))))))).)))))))...................((((((.....))))))(((((((((..(((((.........(((((((...(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((..(((....)))..))))))))))........(((((.(((((.(((((....)).)))..)))))..)))))...)))))))..(((((.((((((.(......).))))))..)))))....))))).)))))))))....((((((((((..(((....)))....(((........))).((((...))))..(((((((.((((.((....)).)).)).))))).))((((((((..((((....)))).))))))))))))))))))(((((......)))))..((((((......((((.((((.((....)).)))).))))..((((...))))))))))..)))).)))..((((......))))))))((((....)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.((((..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((({((....}})....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).{.(((.......))).}.....)))))))))...)))))))))))))).))))))).......,,,,,{{{{,,,{{{{((.....}})))}|{|{{{{{,,,{({....,,,,...{{{{{{{..,(((((....)))))|(((((.(((((....})))).)))))}.((((((((((,,(((....))).,))))))))))..,|||,|||,,,.(((((,(({((....|}.|}|,,}}}||.,||,,,}},}))}}}}..{||||.{{{{{{.{......),}}||||,,||}|}...,}),))})))))))))}...((((((((((..,{(....|,..{,{(({.,{{,...|}}|({{(,..}},),,|{{{{{|||,((.((,...)).)).)).})))).)}((((((((..((((....)))).)))))))))))))))))){((((......))))},.{{{{{|......((((.((((.((....)).)))).)))).(((((...))))))))))..)))).)))}.((((......)))).)))(({{....}).))
Back